24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 3421  |  回复: 13
本帖产生 1 个 MicEPI ,点击这里进行查看

qiaolinkun

银虫 (小有名气)

[求助] 如何鉴定一个新分离纯化获得的菌株的分类地位?

如题
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

天鸟

木虫 (正式写手)

其实简单点,看看杂志上人家做什么指标,你就做什么指标了。
快乐生活,我快乐
8楼2012-01-05 08:45:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

Sunflower89

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫,加油 2012-01-04 16:58:09
qiaolinkun(金币+10): ★★★★★最佳答案 谢了! 2012-01-04 20:55:34
我以细菌为例简单的说一下:
提取总DNA,对16s rRNA基因序列进行扩增(做pcr),对这个序列进行测序(你可以让测序公司给你测),在EZTEXON上进行比 ,就可以初步鉴定这株细菌的分类地位了。
2楼2012-01-04 16:22:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiaolinkun

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by Sunflower89 at 2012-01-04 16:22:37:
我以细菌为例简单的说一下:
提取总DNA,对16s rRNA基因序列进行扩增(做pcr),对这个序列进行测序(你可以让测序公司给你测),在EZTEXON上进行比 ,就可以初步鉴定这株细菌的分类地位了。

只需要做16s rRNA么?
3楼2012-01-04 17:01:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjf008

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
通过16sRNA的pcr进行基因测序,构建系统发育树,楼主是要这样么?
4楼2012-01-04 17:25:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiaolinkun

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by wjf008 at 2012-01-04 17:25:18:
通过16sRNA的pcr进行基因测序,构建系统发育树,楼主是要这样么?

我想知道除了对16s rRNA进行测序是否还需要其它手段进行鉴定?
5楼2012-01-04 17:55:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sunflower89

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5, MicEPI+1): 鼓励新虫,good 2012-01-04 22:24:21
引用回帖:
4楼: Originally posted by wjf008 at 2012-01-04 17:25:18:
通过16sRNA的pcr进行基因测序,构建系统发育树,楼主是要这样么?

对,如果你要是想知道你分离的菌株是属于哪个属,哪个种的话,16s rRNA基因序列比对构建进化树就可以知道了;如果你的目的是鉴定新种的话,做完上面这些步骤,初步鉴定之后,还要进行多相分类学鉴定。
多相分类学鉴定包括表型特征分析(生理生化特征,酶学特征,脂肪酸组分分析等),遗传性分析(16S rRNA基因序列同源比对,基因组DNA的分子杂交 ,G+C含量)和系统发育分析三个方面。
6楼2012-01-04 17:57:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

引用回帖:
6楼: Originally posted by Sunflower89 at 2012-01-04 17:57:36:
对,如果你要是想知道你分离的菌株是属于哪个属,哪个种的话,16s rRNA基因序列比对构建进化树就可以知道了;如果你的目的是鉴定新种的话,做完上面这些步骤,初步鉴定之后,还要进行多相分类学鉴定。
多相分类 ...

请问您口中的“酶学特征”是什么意思,能否举例说明?
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2012-01-05 00:40:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnlbdu

银虫 (正式写手)

回答的很好。
Just to be the best
9楼2013-01-11 16:36:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sunflower89

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2012-01-05 00:40:44
请问您口中的“酶学特征”是什么意思,能否举例说明?...

酶学特征就是你的细菌有哪些酶活性,比如氧化酶、过氧化氢酶、脲酶、色氨酸脱氢酶、鸟氨酸脱氢酶、β-半乳糖苷酶.......等等,具体要做哪些酶是要看你的细菌属于哪个属之后,看它模式菌株都用了哪些指标就可以。
10楼2013-01-27 13:27:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qiaolinkun 的主题更新
信息提示
请填处理意见