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p120933799

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】菌株鉴定小问题之一?

本虫做菌株鉴定方面,从形态学观察是某种真菌,下面打算用基因方面鉴定,请问可否用真菌通用引物ITS1和ITS4的PCR扩增产物测序,之后BLAST比对确定该菌株种属?
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jia1012428

铜虫 (小有名气)


p120933799(金币+1): 2010-11-16 10:20:10
可以,批一下试试哪个批出来用哪个!
2楼2010-11-15 16:30:12
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microxy

铁杆木虫 (著名写手)


p120933799(金币+1): 2010-11-16 10:20:19
可以!
3楼2010-11-15 16:43:17
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minfeng0608

新虫 (初入文坛)


p120933799(金币+3): 2010-11-16 10:20:53
理论上是可以的,不过也有不同菌株ITS区却无差异的现象出现。建议几种方法结合起来,比如26SD1/D2,或者18S区。
4楼2010-11-15 19:14:26
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jfl315

木虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这种方法现在用的还是比较多的
5楼2010-11-16 12:54:07
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jfl315

木虫 (小有名气)


我现在就是用的这种方法
6楼2010-11-16 12:54:27
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jfl0504

木虫 (小有名气)


完全可以
7楼2010-11-16 13:13:20
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duckula7708

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
真菌一般通过形态学观察就可以了,你也可以扩增18S去测序
8楼2010-11-16 15:50:43
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tracy198410

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
形态学观察一般可以把真菌鉴定到属,要更进一步鉴定到种的话就只能提dna扩基因了,一般是扩its1,its4,,和its5;不同种的真菌扩的效果不一样,需要筛选引物~~~
9楼2010-11-16 16:58:58
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