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【求助/交流】菌株鉴定小问题之一?
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p120933799
金虫
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(幼儿园)
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帖子: 196
在线: 69.9小时
虫号: 1034557
[交流]
【求助/交流】菌株鉴定小问题之一?
本虫做菌株鉴定方面,从形态学观察是某种真菌,下面打算用基因方面鉴定,请问可否用真菌通用引物ITS1和ITS4的PCR扩增产物测序,之后BLAST比对确定该菌株种属?
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1楼
2010-11-15 09:56:47
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tracy198410
金虫
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在线: 32.1小时
虫号: 1141744
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
形态学观察一般可以把真菌鉴定到属,要更进一步鉴定到种的话就只能提dna扩基因了,一般是扩its1,its4,,和its5;不同种的真菌扩的效果不一样,需要筛选引物~~~
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9楼
2010-11-16 16:58:58
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jia1012428
铜虫
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在线: 23.1小时
虫号: 577116
p120933799(金币+1): 2010-11-16 10:20:10
可以,批一下试试哪个批出来用哪个!
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2楼
2010-11-15 16:30:12
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minfeng0608
新虫
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虫号: 1019367
p120933799(金币+3): 2010-11-16 10:20:53
理论上是可以的,不过也有不同菌株ITS区却无差异的现象出现。建议几种方法结合起来,比如26SD1/D2,或者18S区。
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4楼
2010-11-15 19:14:26
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jfl315
木虫
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帖子: 195
在线: 5.9小时
虫号: 576606
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
这种方法现在用的还是比较多的
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5楼
2010-11-16 12:54:07
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