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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】菌株鉴定小问题之一？
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p120933799

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】菌株鉴定小问题之一？

本虫做菌株鉴定方面，从形态学观察是某种真菌，下面打算用基因方面鉴定，请问可否用真菌通用引物ITS1和ITS4的PCR扩增产物测序，之后BLAST比对确定该菌株种属？
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1楼 2010-11-15 09:56:47
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tracy198410

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
形态学观察一般可以把真菌鉴定到属，要更进一步鉴定到种的话就只能提dna扩基因了，一般是扩its1，its4，,和its5；不同种的真菌扩的效果不一样，需要筛选引物~~~
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9楼2010-11-16 16:58:58
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jia1012428

铜虫 (小有名气)
p120933799(金币+1): 2010-11-16 10:20:10
可以，批一下试试哪个批出来用哪个！
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2楼2010-11-15 16:30:12
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minfeng0608

新虫 (初入文坛)
p120933799(金币+3): 2010-11-16 10:20:53
理论上是可以的，不过也有不同菌株ITS区却无差异的现象出现。建议几种方法结合起来，比如26SD1/D2，或者18S区。
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4楼2010-11-15 19:14:26
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jfl315

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这种方法现在用的还是比较多的
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5楼2010-11-16 12:54:07
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