24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1857  |  回复: 15

qwky2010

金虫 (著名写手)

[求助] 16s rDN鉴定菌株,没有相似性

现在鉴定一株菌,16s rDNA测序结果正常,但是在ncbi序列比较发现没有与之接近的菌株,同源性95%以上的都是一些未培养微生物或者未知基因,这能说明什么情况,请有经验的指点下,谢谢了
回复此楼
天道酬勤
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

girlfisher

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:21:34
qwky2010(金币+2): 谢谢啦 2011-10-18 18:27:30
有可能是新种,不过应该是用克隆子测序才准确
2楼2011-10-18 09:29:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

power5

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:22:41
克隆测序看一下。直接测序的误差大
3楼2011-10-18 10:29:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

宝杰罗生物

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:24:37
这位同学恭喜你了,你的这株菌基本可以确定是新种,如果同源性在95%以下,可能为新属了;我这里能作新种鉴定。biogenro@yahoo.cn
4楼2011-10-18 10:45:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)


zhang8826857(金币+1): 鼓励一下 2011-10-18 17:20:40
应该考虑
1  提交比对的序列 是不是去掉上下游引物的
2 16s 大概1500bp 需要两个反应从两头测,反应开始的几十个碱基一般归结为不可信区,就是说 可能存在误测但是也可以作为参考
所以建议去掉两端几十个碱基再进行比对。
5楼2011-10-18 11:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qwky2010

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by power5 at 2011-10-18 10:29:27:
克隆测序看一下。直接测序的误差大

什么叫克隆测序呢,能否详细些,谢谢了
天道酬勤
6楼2011-10-18 13:23:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

power5

金虫 (小有名气)

就是pcr以后连接到T载体,然后转化大肠杆菌,送带有质粒的大肠杆菌测序
7楼2011-10-18 13:50:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

494229644

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


zhang8826857(金币+1): 鼓励下,lz可以看看是不是新种啊 2011-10-18 17:21:13
qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啊,运气成分哈, 2011-10-18 18:27:07
新种,意义重大!可以发一系列的文章。
我分了N多菌,没有一个新种,楼主好运气
8楼2011-10-18 16:29:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuhedong1817

木虫 (正式写手)

hello

还是要谨慎!
老婆的头像
9楼2011-10-19 09:00:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hjxevolution

新虫 (小有名气)


zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-10-19 10:26:58
直接测序的前几十bp的序列和800bp之后的序列都不会则么准确 你要对照测序彩图 根据彩图峰型选择准确的序列 然后再进行比对 如果你直接把整个测序序列拿去比对 十有八九都是新种 谨慎!
小虫进化中......
10楼2011-10-19 10:06:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qwky2010 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 复试调剂 +7 春日来信- 2026-04-03 7/350 2026-04-05 12:50 by Hdyxbekcb
[考研] 070300化学求调剂 +17 小黄鸭宝 2026-03-30 17/850 2026-04-05 12:03 by 宁馨哈哈
[考研] 315求调剂 +3 &123456789 2026-04-05 3/150 2026-04-05 11:57 by rainbow11
[考研] 0703化学调剂325分 +9 15771691647 2026-04-04 9/450 2026-04-05 11:39 by 猪会飞
[考研] 生物工程求调剂 +6 喜欢还是不甘心 2026-04-05 6/300 2026-04-05 10:28 by 唐沐儿
[考研] 085602调剂 初试总分335 +12 19123253302 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:08 by 544594351
[考研] +5 雾与海 2026-04-02 6/300 2026-04-04 19:53 by 蓝云思雨
[考研] 0703求调剂 +6 zizimo 2026-03-31 6/300 2026-04-04 14:16 by 无际的草原
[考研] 本9一志愿2 0854低分专硕286求调剂 +9 芒种111 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:01 by tangruihua
[考研] 材料调剂 +11 吴棂颖! 2026-04-03 11/550 2026-04-04 09:56 by 小小树2024
[考研] 材料295 +13 小英11 2026-04-03 14/700 2026-04-04 09:02 by 来看流星雨10
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 求调剂 +9 akdhjs 2026-03-31 11/550 2026-04-03 13:32 by akdhjs
[考研] 08工科,295,接受跨专业调剂 +8 lmnlzy 2026-03-30 8/400 2026-04-03 13:08 by nalakaiqi
[考研] 321求调剂 一志愿 浙江工业大学生物医药 +5 嘿嘿HC 2026-04-01 6/300 2026-04-02 15:23 by sophie2180
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-04-01 3/150 2026-04-01 17:06 by zhouyuwinner
[考研] 调剂申请 +8 张张张张zy 2026-03-31 9/450 2026-04-01 08:29 by zjbkx
[考研] 085404 22408 315分 +5 zhuangyan123 2026-03-31 6/300 2026-03-31 13:48 by limeifeng
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 吉大生物学326分求调剂 +3 sunnyupup 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:28 by longlotian
信息提示
请填处理意见