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qwky2010

金虫 (著名写手)

[求助] 16s rDN鉴定菌株,没有相似性

现在鉴定一株菌,16s rDNA测序结果正常,但是在ncbi序列比较发现没有与之接近的菌株,同源性95%以上的都是一些未培养微生物或者未知基因,这能说明什么情况,请有经验的指点下,谢谢了
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天道酬勤
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hjxevolution

新虫 (小有名气)


zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-10-19 10:26:58
直接测序的前几十bp的序列和800bp之后的序列都不会则么准确 你要对照测序彩图 根据彩图峰型选择准确的序列 然后再进行比对 如果你直接把整个测序序列拿去比对 十有八九都是新种 谨慎!
小虫进化中......
10楼2011-10-19 10:06:42
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girlfisher

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:21:34
qwky2010(金币+2): 谢谢啦 2011-10-18 18:27:30
有可能是新种,不过应该是用克隆子测序才准确
2楼2011-10-18 09:29:34
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power5

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:22:41
克隆测序看一下。直接测序的误差大
3楼2011-10-18 10:29:27
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宝杰罗生物

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

qwky2010(金币+2): 呵呵,谢谢啦 2011-10-18 13:24:37
这位同学恭喜你了,你的这株菌基本可以确定是新种,如果同源性在95%以下,可能为新属了;我这里能作新种鉴定。biogenro@yahoo.cn
4楼2011-10-18 10:45:46
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