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mchen6760

金虫 (正式写手)

[交流] 细菌鉴定:16SrDNA能否鉴定到种? 已有10人参与

16SrDNA序列进行Blast比对,如何对结果进行分析?
测定菌与已知菌种的匹配率(max ident)达到99%,能否可以确定就是同一个种?
如果不能,如何来确定属于哪个种?
谢谢
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12503022

金虫 (正式写手)


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结合生理生化,分子手段不是万能的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2012-04-25 14:18:38
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phoenix.ren

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
形态学;胞壁成分,脂肪酸,糖成分,呼吸醌等化学分类指标。结合生理生化指标,不过生理生化指标也不是那么容易区分。最好是前面列举的化学分类指标。
3楼2012-04-25 15:09:53
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宝杰罗生物

捐助贵宾 (小有名气)



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90%的菌株是鉴定不到种的,结合理化试验,脂肪酸分析,功能基因分析。
4楼2012-04-25 15:48:40
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chibang1220

木虫 (著名写手)

貌似可以吧
人的差别在于业余时间
5楼2012-04-25 16:16:22
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梦想扁舟

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
基本上不能 很多时候只能鉴别到属  要知道什么种结合生理生化实验,结构成分等指标
奋力拼搏
6楼2012-04-25 16:55:51
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zjczie

铜虫 (小有名气)


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要做生理生化实验才可以鉴定到种
7楼2012-04-25 17:44:45
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mchen6760

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 宝杰罗生物 at 2012-04-25 15:48:40:
90%的菌株是鉴定不到种的,结合理化试验,脂肪酸分析,功能基因分析。

继续请教:如何根据16SrDNA序列分析、生理生化、结构成分等来确定筛出来的菌是不是一个新种?
8楼2012-04-25 19:50:44
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391579557

木虫 (正式写手)

哎,看你做到什么程度了。我也在为这个问题焦灼啊。必经不是做分子的。
求实,所以来小木虫!
9楼2012-04-25 20:04:38
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mchen6760

金虫 (正式写手)

DNA-DNA分子杂交,能说明什么问题呢?
10楼2012-04-25 20:23:40
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