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tiger86gyc

新虫 (初入文坛)

[求助] 我去做菌种鉴定16S RNA 测出来5条 片段……请问这是怎么回事?

是拿出去做的,有人可以帮我分析下这是怎么回事呢?求高手。我第一次做这个,不太明白,听说一般只会有 一条或者两条。结果都放在附件上了。个人怀疑是菌种不纯……还有没有其他原因?或者它就是这个样子的?
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zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-16 17:15:30
tiger86gyc: 金币+7, ★★★很有帮助, 谢谢,看来你还帮我查了一下,我才学会用BLASK 2012-05-18 10:17:47
你鉴定的菌大概是什么菌呀?可以大致判定你的五个结果有三个菌。1号是一种,2和4号大致是芽孢杆菌属的,3和5是另一个菌属的。可以进一步对测序序列进行比对分析呀!
2楼2012-05-16 16:42:49
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uneei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你拿什么样品出去测的啊?PCR样品还是菌液呢?直接测序还是克隆测序?
3楼2012-05-16 19:36:11
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tiger86gyc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhsDONG at 2012-05-16 16:42:49:
你鉴定的菌大概是什么菌呀?可以大致判定你的五个结果有三个菌。1号是一种,2和4号大致是芽孢杆菌属的,3和5是另一个菌属的。可以进一步对测序序列进行比对分析呀!

谢谢你的回复,因为是分离出来的,所以是未知的菌。。。比对分析,还在学习中……
4楼2012-05-18 10:17:12
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andylihuilai

新虫 (小有名气)


如果只是一个菌株,说明是不纯,对方测了5个克隆,就有3个种,如果是样品的话5个克隆还不够
5楼2014-07-28 15:18:37
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