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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 我去做菌种鉴定16S RNA 测出来5条 片段……请问这是怎么回事？
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tiger86gyc

新虫 (初入文坛)

[求助] 我去做菌种鉴定16S RNA 测出来5条 片段……请问这是怎么回事？

是拿出去做的，有人可以帮我分析下这是怎么回事呢？求高手。我第一次做这个，不太明白，听说一般只会有 一条或者两条。结果都放在附件上了。个人怀疑是菌种不纯……还有没有其他原因？或者它就是这个样子的？
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1楼 2012-05-16 15:54:27
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andylihuilai

新虫 (小有名气)
如果只是一个菌株，说明是不纯，对方测了5个克隆，就有3个种，如果是样品的话5个克隆还不够
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5楼2014-07-28 15:18:37
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zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-16 17:15:30
tiger86gyc: 金币+7, ★★★很有帮助, 谢谢，看来你还帮我查了一下，我才学会用BLASK 2012-05-18 10:17:47
你鉴定的菌大概是什么菌呀？可以大致判定你的五个结果有三个菌。1号是一种，2和4号大致是芽孢杆菌属的，3和5是另一个菌属的。可以进一步对测序序列进行比对分析呀！
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2楼2012-05-16 16:42:49
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uneei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你拿什么样品出去测的啊？PCR样品还是菌液呢？直接测序还是克隆测序？
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3楼2012-05-16 19:36:11
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tiger86gyc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhsDONG at 2012-05-16 16:42:49:
你鉴定的菌大概是什么菌呀？可以大致判定你的五个结果有三个菌。1号是一种，2和4号大致是芽孢杆菌属的，3和5是另一个菌属的。可以进一步对测序序列进行比对分析呀！

谢谢你的回复，因为是分离出来的，所以是未知的菌。。。比对分析，还在学习中……
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4楼2012-05-18 10:17:12
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