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求助!!帮忙分析一下荧光定量的溶解曲线!!已有1人参与
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第一张是标准曲线和高表达量样品的溶解曲 第二张是低表达量样品的溶解曲线 也就是说二者的差别只在于模板量的多与少,可是这溶解曲线上的“鼓包”着实让人看着不爽啊~~大家帮忙分析一下,看是怎么解决!拜托!拜托!! 1.png 2.png |
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2楼2015-01-27 15:18:38
3楼2015-01-27 21:49:20

4楼2015-01-28 11:56:29
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xiaohaixie(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:11:43
xiaohaixie(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:11:43
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你的待测样品ct已经到32左右了。属于比较高的值了。不是很理想,这样的话,加上你的溶解曲线,真的会去怀疑你的低浓度扩增是否非特异。 因为以你的描述,引物使用是一致的,并且模板内容也是一样的,这样的话,高浓度下看起来引物并无太大问题,所以如果你是在做绝对定量,稀释的倍数不要太大,高浓度23cycle,低浓度32cycle这样差异太大了。调整低浓度在26cycle这样就能避免一些奇怪的事情 |
» 本帖已获得的红花(最新10朵)
5楼2015-01-28 18:49:34
送红花一朵|
时间紧,所以之前就多合成了一对引物,昨天晚上稀释了一对新引物,序列与这对引物不同,问题解决了。所有待测样品都是细胞提RNA然后反转录后进行定量,不同的地方也就是细胞中该基因的表达量不同,在高表达mRNA和高浓度标准质粒中,产物单一,且无引物二聚体;低表达量中正如您所说问题就来了,关键还是条带不单一,之前跑琼脂糖胶也没分辨出来,引物浓度梯度也试了,降低了引物浓度,结果确实有很大改善,但是杂峰依然存在,说明有二聚体也有杂带。实验室前期有过一次气溶胶污染,摸条件时可是害苦了我,所以昨天一狠心,引物全换新的,到同学的实验室稀释、加样做定量,结果良好。 总结一下:关键是引物特异性不好,其次是有污染,因为前期用标准曲线样品进行PCR时发现高浓度标准样品中有杂带,越往低杂带就慢慢没了,所以平时严谨点不光是对自己负责,更是对别人负责,我的一个月时间就这样白白耗走了,再次感谢您的耐心回复! |

6楼2015-01-29 16:08:28
7楼2015-01-29 17:42:48













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