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~艾斯~

银虫 (正式写手)

[求助] 已知GAPDH基因及其引物序列,求扩增产物片段大小 已有3人参与

如题,已知内参基因GAPDH,genebank ID:NM 008084.2
已知引物序列:F:AGGTCGGTGTGAACGGATTTG    R:GGGGTCGTTGATGGCAACA
求PCR产物的片段大小。这个引物是从一个博士论文里面摘下来的,博士论文题目为“小鼠巨噬细胞 TLR2、TLR4 及 RP105 在金黄色葡萄球菌感染中
的天然免疫应答机制”


求各位高手帮忙解答,我PCR该GAPDH产物,条带显示在100bp左右,我怕因为我前期RNA提取的不好,导致片段不正确,急求!!!谢谢
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~艾斯~

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangyunjing at 2015-01-06 10:36:26
片段大小为95 bp,见附件

360截图20150106103425000-1.jpg

太感谢了,我昨天PCR了一下TLR1,那个片段我知道大小,是300bp左右,所以我估计我这个内参是100bp左右没啥错误。你太厉害了,非常非常感谢!
6楼2015-01-06 11:00:31
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
~艾斯~: 金币+5, 有帮助 2015-01-05 08:25:13
在primer5里面把基因和引物初进里面应该可以找出来
2楼2015-01-04 21:36:04
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~艾斯~

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-04 21:36:04
在primer5里面把基因和引物初进里面应该可以找出来

实在是抱歉,我不太会弄这个,这个引物应该是修改过碱基的,我把FR引物对应序列弄出来之后在该基因的全序列中找了一下,基本几个碱基之后就断了。。。如果你会弄这个的话,能不能帮忙找一下啊?万分感谢啊
3楼2015-01-05 08:24:59
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阿尔卑斯英

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把上下游引物放在BLAST primer里面即可查到
4楼2015-01-06 10:27:45
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