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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 已知GAPDH基因及其引物序列，求扩增产物片段大小
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~艾斯~

银虫 (正式写手)

[求助] 已知GAPDH基因及其引物序列，求扩增产物片段大小已有3人参与

如题，已知内参基因GAPDH，genebank ID：NM 008084.2
已知引物序列：F：AGGTCGGTGTGAACGGATTTG    R：GGGGTCGTTGATGGCAACA
求PCR产物的片段大小。这个引物是从一个博士论文里面摘下来的，博士论文题目为“小鼠巨噬细胞 TLR2、TLR4 及 RP105 在金黄色葡萄球菌感染中
的天然免疫应答机制”


求各位高手帮忙解答，我PCR该GAPDH产物，条带显示在100bp左右，我怕因为我前期RNA提取的不好，导致片段不正确，急求！！！谢谢
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1楼2015-01-04 21:05:57
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
~艾斯~: 金币+5, ★有帮助 2015-01-05 08:25:13
在primer5里面把基因和引物初进里面应该可以找出来
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2楼2015-01-04 21:36:04
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~艾斯~

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-04 21:36:04
在primer5里面把基因和引物初进里面应该可以找出来

实在是抱歉，我不太会弄这个，这个引物应该是修改过碱基的，我把FR引物对应序列弄出来之后在该基因的全序列中找了一下，基本几个碱基之后就断了。。。如果你会弄这个的话，能不能帮忙找一下啊？万分感谢啊
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3楼2015-01-05 08:24:59
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阿尔卑斯英

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把上下游引物放在BLAST primer里面即可查到
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4楼2015-01-06 10:27:45
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zhangyunjing

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
~艾斯~: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-01-06 11:00:39
片段大小为95 bp，见附件
已知GAPDH基因及其引物序列，求扩增产物片段大小
360截图20150106103425000-1.jpg
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rainwater
5楼2015-01-06 10:36:26
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~艾斯~

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangyunjing at 2015-01-06 10:36:26
片段大小为95 bp，见附件

360截图20150106103425000-1.jpg

太感谢了，我昨天PCR了一下TLR1，那个片段我知道大小，是300bp左右，所以我估计我这个内参是100bp左右没啥错误。你太厉害了，非常非常感谢！
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6楼2015-01-06 11:00:31
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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)
in sillico PCR online program.....user friendly....
http://insilico.ehu.es/PCR/
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向钱看，向厚赚
7楼2015-01-06 23:48:10
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高剑基

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangyunjing at 2015-01-06 10:36:26
片段大小为95 bp，见附件

360截图20150106103425000-1.jpg

我想问问你这是用什么软件查询的？具体的操作能否简单说一说？万分感谢！
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8楼2018-08-09 23:42:43
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