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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于PCR产物的鉴定
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玻璃花1

金虫 (小有名气)

[求助] 关于PCR产物的鉴定 已有4人参与

以海杆菌基因组为模板扩增一个基因的片段，引物是根据几个属中该基因的保守区设计的，引物有兼并，但扩出的结果条带单一，且条带长度与估计的长度吻合，但是该基因的保守性差，且没有报道出海杆菌属的这个基因序列，也就是说没法确定扩增的片段是不是目的片段，想问问大家有什么建议，或者说想知道我扩增出的长度吻合的单一片段不是我要的目的片段的概率大吗？急啊，求解!
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1楼 2014-12-22 17:02:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
测序不就知道了吗？如果产物单一，可以直接送PCR产物测序。
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2楼2014-12-22 19:49:54
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clark2010

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
玻璃花1: 金币+50, ★有帮助 2014-12-23 11:26:15
PCR产物测个序，然后用DNA序列BLASTX一下，这样能看出蛋白水平的相似性，预测一下功能。
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3楼2014-12-22 20:57:29
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转pmd-18t进行测序，
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4楼2014-12-22 21:09:51
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superior111

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-23 19:10:08
产物连T载，转化，抽质粒，测个序就好了。

[ 发自小木虫客户端 ]
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Mol是分子生物学molecularbiology前三个字母，EPI=EmuchProfessionalIndex，即小木虫专家指数，MolEPI也就是小木虫分子生物版专家指数。
5楼2014-12-22 23:01:55
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玻璃花1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by clark2010 at 2014-12-22 20:57:29
PCR产物测个序，然后用DNA序列BLASTX一下，这样能看出蛋白水平的相似性，预测一下功能。

就是连接T载体之后测序的结果，想继续请教一下怎么预测蛋白功能
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6楼2014-12-23 11:26:01
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clark2010

金虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-23 19:10:18
blastx,输进去DNA序列，然后系统给你比对蛋白序列库，这样的话看看下面相似的蛋白都有些什么功能。如果没有这个都没有相似性，那我就没办法了。只能求助于高手了。
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7楼2014-12-23 18:53:31
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玻璃花1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by clark2010 at 2014-12-23 18:53:31
blastx,输进去DNA序列，然后系统给你比对蛋白序列库，这样的话看看下面相似的蛋白都有些什么功能。如果没有这个都没有相似性，那我就没办法了。只能求助于高手了。

恩，谢谢~
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8楼2014-12-23 21:05:20
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