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阿南hmily

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[求助] 关于在NCBI上BLAST的结果分析已有2人参与

最近在NCBI上将一株噬菌体和一株大肠杆菌序列进行了比对，出现了图中所示的结果，请问是什么意思？我该怎么分析呢？求大侠指教！

BLAST.jpg

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1楼 2014-12-22 10:39:50

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fangbeibei99

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【答案】应助回帖

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是不是比对的方法不对啊！两个序列的比对结果怎么会是这样的！

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微信公众号BioHook学生物就是这么任性

2楼2014-12-22 11:35:23

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liuderong

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【答案】应助回帖

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这是以图形的形式展示比对结果，页面往下拉就可以看到序列匹配结果。你的序列好长，估计是网站显示不出来，或者要加载很长时间，你没等加载完就关闭页面了。你可以拿两个短一点的序列blast，一看就明白了。

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3楼2014-12-22 11:55:28

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阿南hmily

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引用回帖:

3楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-22 11:55:28
这是以图形的形式展示比对结果，页面往下拉就可以看到序列匹配结果。你的序列好长，估计是网站显示不出来，或者要加载很长时间，你没等加载完就关闭页面了。你可以拿两个短一点的序列blast，一看就明白了。

我想将我刚测序的一株噬菌体和宿主菌的序列进行BLAST比对，那么进入下面的界面中，哪里添加噬菌体序列，哪里添加宿主菌序列？我标记出来的地方该怎么选择参数呢？
请指教！！十分感谢！！

360截图20141222165605906.jpg

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4楼2014-12-22 17:00:56

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★ ★ ★ ★ ★
阿南hmily: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-12-22 21:32:15

两条已知序列比对不是在这个网站页面的，要到这里http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq，里头有两个框，把你的两条序列放进去比对就行。那条序列放哪个框都不要紧的。

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5楼2014-12-22 20:03:35

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5楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-22 20:03:35
两条已知序列比对不是在这个网站页面的，要到这里http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&BLAST_SPEC=blast2seq&LINK_LOC=align2seq，里头有两个框，把你的两条序列放进去比对就行 ...

那上面我说的那个网站，对目标序列进行BLAST是与全部的基因序列对比出现的结果吗？

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6楼2014-12-22 20:42:42

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