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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于在NCBI上BLAST的结果分析
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 阿南hmily at 2014-12-22 21:25:19
十分不好意思，再问一下，下图中是噬菌体和大肠杆菌对比出来的结果，请问光看这图是说序列相似性很低，打分都在40分以下？因为看过其他的图下面都有红绿蓝等颜色的横线
另外，同源性怎么看？
谢谢！

BLAST.jpg
...

blast是做局部比对的，适合短序列，不适合基因组级别的序列。你的序列很长，建议到百度搜一下基因组比对软件。比对软件给出的都是相似性，也就是有多少相同和多少不同，而无法给出同源性。还有同源性是针对基因来说的，基因组没有“同源”的说法。感觉你还得跟你同学或者导师讨论一下比对的目的和方法。
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阿南hmily
11楼2014-12-22 21:41:52
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 阿南hmily at 2014-12-22 21:29:58
嘿嘿，再问一个问题：在对比结果页面中，点击箭头所示的红色方框，出现最下面图，是表达什么信息？这个图该怎么看？那条是噬菌体序列那条是宿主菌序列？毫无头绪，请指导！
谢谢！谢谢！谢谢！

流程.jpg

图解.j ...

也是以一种图形的形式展示结果
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12楼2014-12-22 22:21:56
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阿南hmily

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-22 21:41:52
blast是做局部比对的，适合短序列，不适合基因组级别的序列。你的序列很长，建议到百度搜一下基因组比对软件。比对软件给出的都是相似性，也就是有多少相同和多少不同，而无法给出同源性。还有同源性是针对基因来说 ...

非常感谢！
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13楼2014-12-23 12:46:11
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