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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 阿南hmily at 2014-12-22 21:25:19
十分不好意思,再问一下,下图中是噬菌体和大肠杆菌对比出来的结果,请问光看这图是说序列相似性很低,打分都在40分以下?因为看过其他的图下面都有红绿蓝等颜色的横线
另外,同源性怎么看?
谢谢!

BLAST.jpg
...

blast是做局部比对的,适合短序列,不适合基因组级别的序列。你的序列很长,建议到百度搜一下基因组比对软件。比对软件给出的都是相似性,也就是有多少相同和多少不同,而无法给出同源性。还有同源性是针对基因来说的,基因组没有“同源”的说法。感觉你还得跟你同学或者导师讨论一下比对的目的和方法。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2014-12-22 21:41:52
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 阿南hmily at 2014-12-22 21:29:58
嘿嘿,再问一个问题:在对比结果页面中,点击箭头所示的红色方框,出现最下面图,是表达什么信息?这个图该怎么看?那条是噬菌体序列那条是宿主菌序列?毫无头绪,请指导!
谢谢!谢谢!谢谢!

流程.jpg

图解.j ...

也是以一种图形的形式展示结果
12楼2014-12-22 22:21:56
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阿南hmily

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-22 21:41:52
blast是做局部比对的,适合短序列,不适合基因组级别的序列。你的序列很长,建议到百度搜一下基因组比对软件。比对软件给出的都是相似性,也就是有多少相同和多少不同,而无法给出同源性。还有同源性是针对基因来说 ...

非常感谢!
13楼2014-12-23 12:46:11
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