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可否用相对定量检测不同基因的表达丰富比例变化?
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andywang6137
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可否用相对定量检测不同基因的表达丰富比例变化?
比如有A、B、C三个基因,处理前和处理后相对定量看他们的表达差异之外,还想看他们的丰度变化情况。假设A基因(相对内参),初始值为1,处理后表达为8倍,为8;B基因,初始值为10,处理后变成4倍,为40;C基因初始值为100,处理后升高2倍,为200。这样处理前后,表达都发生了变化。虽然C基因表达倍数上调最小,但其所占三个基因之比例[C/(A+B+C)]仍然最高。相对定量能否完成?
我看了几篇文献都是用绝对定量,一方面绝对定量要用探针,比相对定量染色法要贵很多,另外一个,还需要克隆到质粒里边,测质粒拷贝数,做标准曲线。这方面我没做过。之前只做过相对定量。
我不需要知道三个基因的具体拷贝数,然后计算所占比例;知道他们相对内参基因的比值,所占比例不是一样可以获得吗?疑惑,不明白,请指教。谢谢!
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2014-12-08 15:08:00
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