24小时热门版块排行榜    

查看: 3302  |  回复: 3

kakabada123

新虫 (初入文坛)

[交流] 上下游引物的设计问题 已有3人参与

上下游引物的设计,
最早在NCBI--gene--输入(实验动物)空格(基因)方法,未搜出
通过文献找,找到一篇,问题一:我在copy时,下游引物抄错了,发给公司合成,会出现什么后果?
问题二:后来,我多看了一些文献,又发现一篇文献,但是同样动物,同样基因,不同序列。。是怎么回事呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

289363400

铁杆木虫 (知名作家)

凌乱前进方向

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-17 10:38:05
建议你补充一下引物设计的基本知识。问题一的解答:这要看你错的多少了,比如说你引物上有酶切位点,你恰好又COPY错了,那么接下来有关酶切的实验步骤你是做不下去的;而如果错误的区域是在引物当中涉及CDS的区域,那么一旦影响到编码的蛋白或者终止密码子,引物肯定就不能用了的。问题二的解答:引物的设计常常以覆盖基因的CDS区域为基本要求,还跟你将来要插入的质粒有关。所以引物不是一定的,还可以在不影响引发效率和将来蛋白表达的情况下做一定碱基的修饰替换。我这样说肯定说不清,还是建议楼主补充一下相关方面的知识,网上关于引物设计的内容很多的。
2楼2014-11-17 09:47:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoliwang

至尊木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
错多少呗,几个碱基的话,产物会被引入突变,错的多,PCR失败。如果错误引物与其它位置序列相同或相似,可扩出非预期长度的片段。
你可以把引物序列输入blast,在有相似序列的基因里找找看,序列不同可以因为isoform、多态性等原因。
慎思明辨博学笃行
3楼2014-11-17 21:24:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever909

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那个碱基序列有很多的,只是说每个人选择是不同的,有的人侧重匹配率,有的人侧重有无交叉序列,都是要综合考虑的
快乐是最重要的。。。。。。
4楼2014-11-18 11:35:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kakabada123 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +10 布布和一二 2026-08-08 17/850 2026-08-09 14:45 by ttzzttzz01
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +4 Lanmanbaby 2026-08-09 4/200 2026-08-09 14:19 by 超级海虾
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:22 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 15:07 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WQyTGMbfH7Cx 2026-08-07 4/200 2026-08-08 15:02 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
请填处理意见