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Young-Tiger

金虫 (小有名气)

[求助] 连接载体一直连不上 已有2人参与

插入片段450bp,要连接的载体有7kb左右,一端平(StuI)一端粘(Bsu36I),浓度设置上,载体:50ng,载体插入片段摩尔比是1:3;连接酶,NEB的5min Quick Ligase 和promega的3h T4都用过了,还是没长出来。昨天一个关键的对照是,我用同样的插入片段同样的酶切位点连一个较小的载体(3kb pGEM)连接成功,所以问题总结后就是,同一个插入片段连小载体成功连大载体失败,请高手指点该怎么改进。
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Enjoymylife
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s_lich28

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-10-19 18:20:39
Young-Tiger: 金币+25, ★有帮助 2014-10-20 20:57:56
楼主的载体最好也要有个positive control,保证闭环的载体转然后可以长出菌落。然后楼主可以试试提高插入片段的比例,片段载体比可以提高到20:1,别担心出现串联插入,双酶切出现串联插入的可能性很小。祝连接成功!
There is nothing either good or bad, thinking makes it so.
2楼2014-10-18 00:26:53
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Young-Tiger

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by s_lich28 at 2014-10-18 00:26:53
楼主的载体最好也要有个positive control,保证闭环的载体转然后可以长出菌落。然后楼主可以试试提高插入片段的比例,片段载体比可以提高到20:1,别担心出现串联插入,双酶切出现串联插入的可能性很小。祝连接成功!

马上去试,万分感谢
Enjoymylife
3楼2014-10-18 01:07:03
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593318518

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-10-19 18:20:43
Young-Tiger: 金币+25, ★有帮助 2014-10-20 20:58:05
我觉得可能是载体酶切有问题。可能酶切位点突变
4楼2014-10-18 10:45:32
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Young-Tiger

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 593318518 at 2014-10-18 10:45:32
我觉得可能是载体酶切有问题。可能酶切位点突变

今天的结果印证了这一点,我按照二楼兄弟的建议,做了positive control  长得满满当当堪比清明上河图,把比例提高到了20:1 还是没有长东西,同时我设置了一个奇葩的对照,把从表达载体上切下来的那段重新连回去,竟然也没长出来,基本印证了酶切位点发生了突变或者星活性切了不该切的地方。
Enjoymylife
5楼2014-10-18 22:31:54
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