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hakkie

新虫 (初入文坛)

[求助] Real time 加样问题! 已有7人参与

最近做real time, 用的10u的体系,加样顺序:(Sybr Green Master Mix+H2O(共7u))*n,加样;(引物Mix2u+cDNA1u)*n,混匀,加样。三个平行孔,结果三个孔的反应结果相差很大,Ct值差距最大为3!也就是说加样误差很大。加引物Mix时一样的引物没有换枪头,cDNA也一样,不知道有没有这样加的,这样会有多大的误差?
    如果引物Mix和cDNA分开加,又使加样过程很繁琐,不仅容易出错,个人觉得加1u cDNA,等加到最后一孔了,第一个孔的cDNA是不是会已经蒸发掉一些。。。
    另外加完Sybr Green Master Mix和水后,再加引物和模板时是加的壁上好,还是直接加进反应液里?觉得直接加进反应液误差小,但容易有气泡,离心也难去除。
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bwangel

银虫 (小有名气)

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hakkie(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-26 19:21:47
MIX当然最好,但是麻烦的话可以选择引物,模板单加,混合液混后加,在加的时候注意枪和枪头要好,枪头建议用进口的,另外,你加完离心吗?如果不离心,一个小技巧,枪别打到底,加壁上
2楼2014-09-26 15:13:31
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陌路行客

金虫 (小有名气)

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hakkie(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-29 19:49:53
另外,加样时确保液体完全打出,还有移液枪的准确性也是一个重要影响因素
人生中的悲剧太多了
3楼2014-09-27 12:16:12
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

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hakkie(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-29 19:49:59
除了模板以外,都先配成混合液,分装到孔里,最后一个个加模板,换枪头,每个孔的操作都一样(比如加模板的时候在每个孔中都吹吸2次)。重复性孔就是用来检验加模板的技术是否可信。
4楼2014-09-28 08:52:48
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

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还有注意反应液蒸发问题,溶液浓缩了扩增效率就不同,本身也影响吸光度。
5楼2014-09-28 08:54:18
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周硕

铁虫 (初入文坛)

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hakkie(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-29 19:50:17
将SYBR,引物,水,混成Mix后加。
然后加cDNA。
cDNA稀释程度可以大一点,我一般是稀释20倍,然后每个孔加5uL.
6楼2014-09-28 09:26:20
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chenguestc

木虫 (职业作家)

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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-29 19:50:25
除了DNA之外,其余所有成分混匀。
混合液混匀好之后放在冰上,再加DNA,完了之后分混合液。
加DNA时一定要保证枪头内全部打出,这个是造成结果差异的最主要原因。
若样品多,尽量用排枪加,不必担心不同枪头之间的差异,但是得保证液体全部打出。
7楼2014-09-28 09:53:54
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wwjcas570

木虫 (著名写手)

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-29 19:50:38
体系比较少,建议用20微升的体系,这些误差会小一点。
我们有时候做3个重复,有时候会做4个重复。
加样的时候速度稍微快一点,放在冰上,减小蒸发作用。
8楼2014-09-28 18:21:50
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bbqlhb

木虫 (小有名气)

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试试mix跟cDNA分开加,我想效果就明显了,同时10ul太小了,我没做过这么低的
9楼2014-09-29 15:04:04
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