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well_想太多

新虫 (小有名气)

[求助] 关于目的基因导入pet-28a中是否会发生移码问题! 已有4人参与

本人想用pet-28a作为表达载体,引物 已经设计完了,才意识到移码的问题.想问问怎么看我的目的基因导入进28a后是否会发生移码呢?我选的酶切问点分别是BamHI和HindIII, 需要看目的基因序列吗?还是看引物?我在我的酶切位点前面加了2-3个保护碱基:CG GGATCC CG   BamHI
             CCC AAGCTT GGG   HindIII
引物分别是:5`>CG GGATCC CG ATGTCTCTTCGACGTATTCTC<3`
                   5`>CCC AAGCTT GGGTCAGCAGTACAGGTTGCC<3`
如果发生移码了,是不是需要从新设计引物P目的基因序列?
下面是CDS序列,新手,勿怪!

ATGTCTCTTC GACGTATTCT CGCGGCGGTCGCCGCCACCTTCGCCGCCACCACGGTCGCCGTGGTCGTCC
CGACGCAGTCCGCCTCCGCCGCGGACTGCGTGGCGCCGTGGAACGCGAGTTCGGTCTACTGGGGCGGCAA
CACCGCGTCCTACAACGGGCACAACTGGTCCGCGAAGTGGTGGACGCAGAACGAAACCCCAGGTGCAGCG
CAGGTCTGGGCCGATCAGGGCGCCTGCGGCGGCGGGACGACCAACCCGCCGAACCCGTCCGGCTTCGTGG
ACAGTTCAACCAGATGTTCCCGAGCCGGAATCCCTTCTACACCTACAACGGCCTGGTCAC
CGCGCTCAGCGCCTACCCGGCCTTCGCGGGCACGGGCAGCGACACCGTGAAGAAGCAGGAAGCGGCGGCC
TTCCTGGCGAACGTCAGCCACGAGACCGGCGGACTGGTCCACATCGTCGAGCAGAACGAAGCGAACTACC
CGCACTACTGCGACACGAGCCAGTCCTACGGCTGCCCCGCCGGCAACGCCGCGTACTACGGCCGCGGCCC
GATCCAGCTCAGCTGGAACTTCAACTACAAGGCCGCCGGCGACGCGCTCGGCCTGCCACTGCTGACCAAC
CCGTGGCTGGTGCAGAACGACGCGGCGGTCGCCTGGAAGACCGGCATCTGGTACTGGATGACCCAGAACG
GTCCCGGCACGATGACCCCGCACAACGCGATGGTCAACAGCCGCGGCTTCGGCGAGACGATCCGCAGCAT
CAACGGGAGCATCGAGTGCAACGGCGGCAACCCCGCCCAGGTGCAGAGCCGCGTGAACAAGTACCAGCAG
TTCACCGGCATCCTCGGCGTCACCCCCGGCGGCAACCTGTACTGCTGA
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well_想太多

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bolysu at 2014-09-23 09:21:18
移不移码,是从载体上看的,载体上开始翻译的ATG,三个三个数,看是否正好到你的ATG正好是3的整数倍。

上面那条引物应该是会移码,我又加了一个保护碱基.5`>CGc GGATCC CGc ATGTCTCTTCGACGTATTCTC<3`,这样应该就不会了吧
6楼2014-09-23 13:40:36
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查看全部 11 个回答

bolysu

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
well_想太多: 金币+1, 有帮助 2014-09-23 13:42:38
本帖内容被屏蔽

2楼2014-09-23 09:21:18
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whh2013

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
重新扩吧,和我一样的问题,
3楼2014-09-23 11:03:21
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whh2013

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你不是从ATG扩的吗?这样没有没有问题啊
4楼2014-09-23 11:05:49
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