24小时热门版块排行榜    

查看: 4748  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

well_想太多

新虫 (小有名气)

[求助] 关于目的基因导入pet-28a中是否会发生移码问题! 已有4人参与

本人想用pet-28a作为表达载体,引物 已经设计完了,才意识到移码的问题.想问问怎么看我的目的基因导入进28a后是否会发生移码呢?我选的酶切问点分别是BamHI和HindIII, 需要看目的基因序列吗?还是看引物?我在我的酶切位点前面加了2-3个保护碱基:CG GGATCC CG   BamHI
             CCC AAGCTT GGG   HindIII
引物分别是:5`>CG GGATCC CG ATGTCTCTTCGACGTATTCTC<3`
                   5`>CCC AAGCTT GGGTCAGCAGTACAGGTTGCC<3`
如果发生移码了,是不是需要从新设计引物P目的基因序列?
下面是CDS序列,新手,勿怪!

ATGTCTCTTC GACGTATTCT CGCGGCGGTCGCCGCCACCTTCGCCGCCACCACGGTCGCCGTGGTCGTCC
CGACGCAGTCCGCCTCCGCCGCGGACTGCGTGGCGCCGTGGAACGCGAGTTCGGTCTACTGGGGCGGCAA
CACCGCGTCCTACAACGGGCACAACTGGTCCGCGAAGTGGTGGACGCAGAACGAAACCCCAGGTGCAGCG
CAGGTCTGGGCCGATCAGGGCGCCTGCGGCGGCGGGACGACCAACCCGCCGAACCCGTCCGGCTTCGTGG
ACAGTTCAACCAGATGTTCCCGAGCCGGAATCCCTTCTACACCTACAACGGCCTGGTCAC
CGCGCTCAGCGCCTACCCGGCCTTCGCGGGCACGGGCAGCGACACCGTGAAGAAGCAGGAAGCGGCGGCC
TTCCTGGCGAACGTCAGCCACGAGACCGGCGGACTGGTCCACATCGTCGAGCAGAACGAAGCGAACTACC
CGCACTACTGCGACACGAGCCAGTCCTACGGCTGCCCCGCCGGCAACGCCGCGTACTACGGCCGCGGCCC
GATCCAGCTCAGCTGGAACTTCAACTACAAGGCCGCCGGCGACGCGCTCGGCCTGCCACTGCTGACCAAC
CCGTGGCTGGTGCAGAACGACGCGGCGGTCGCCTGGAAGACCGGCATCTGGTACTGGATGACCCAGAACG
GTCCCGGCACGATGACCCCGCACAACGCGATGGTCAACAGCCGCGGCTTCGGCGAGACGATCCGCAGCAT
CAACGGGAGCATCGAGTGCAACGGCGGCAACCCCGCCCAGGTGCAGAGCCGCGTGAACAAGTACCAGCAG
TTCACCGGCATCCTCGGCGTCACCCCCGGCGGCAACCTGTACTGCTGA
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子问题及解决方案汇总 核酸方面

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

well_想太多

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by whh2013 at 2014-09-23 11:03:21
重新扩吧,和我一样的问题,

恩,从新设计了一条引物
5楼2014-09-23 13:39:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

well_想太多

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bolysu at 2014-09-23 09:21:18
移不移码,是从载体上看的,载体上开始翻译的ATG,三个三个数,看是否正好到你的ATG正好是3的整数倍。

上面那条引物应该是会移码,我又加了一个保护碱基.5`>CGc GGATCC CGc ATGTCTCTTCGACGTATTCTC<3`,这样应该就不会了吧
6楼2014-09-23 13:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

well_想太多

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by whh2013 at 2014-09-23 11:05:49
你不是从ATG扩的吗?这样没有没有问题啊

但是转进pet-28a就会移码啊
7楼2014-09-23 13:43:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

well_想太多

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 393658000 at 2014-09-24 09:20:23
不懂为何你要在BamHI中间塞入碱基,因为你既然选择了BamHI作为第一个酶,那么你就默认了需要用到载体本身上的5‘His,这样的话你的第一条引物塞入了2个碱基,所以后面ORF肯定移码,你要么不塞,要么塞3的倍数,但是个 ...

谢谢前辈的指教,我们老师要求加入保护碱基,本来我也是不打算加的,不过查阅资料说加入保护碱基后酶切时会更高效地切开。
11楼2014-10-01 22:47:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 well_想太多 的主题更新
信息提示
请填处理意见