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njyang2006

金虫 (正式写手)

[求助] 请问用Vector NTI如何实现在pET28a中加入目的基因片段的谱图绘制。

本人选用上游Nde I,下游Xho I酶切位点。
绘制谱图时发现pET28a的谱图中启动子和终止子的顺序刚好与实际的方向相反,请问这种情况下,如何把目的基因片段添加进去?
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励积极应助! 2012-03-01 18:09:25
njyang2006(金币+2): ★★★很有帮助 2012-03-02 19:49:37
如果按照vector软件操作说明上一步一步来,先将片段酶切,再将载体酶切,再连接,这样软件会识别酶切位点处的粘性末端,方向软件会自动识别。(当然这样画图谱我觉得挺麻烦的)

我一般直接将载体两酶切位点间其他酶切位点序列删掉,然后将目的片段当序列插入到载体两酶切位点中(估计你也想这么干),然后将插入的序列add feature。遇到你这种启动子和终止子方向相反的情况,我先将目的基因reverse一下,然后同上面操作。这时候add feature时,在complementary前面打上勾,这样基因就和启动子方向保持一致了。
Thank-you,so-blue.
3楼2012-03-01 14:06:04
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

chuan2388

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
njyang2006(金币+3): ★★★很有帮助 2012-03-02 19:49:19
先将pET28a reverse,然后再插入基因序列
把时间都浪费在自己身上吧!
9楼2012-03-02 17:34:56
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普通回帖

njyang2006

金虫 (正式写手)

自己顶一下,沉下去就没戏了
2楼2012-03-01 13:42:38
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njyang2006

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by susizheng at 2012-03-01 14:06:04:
如果按照vector软件操作说明上一步一步来,先将片段酶切,再将载体酶切,再连接,这样软件会识别酶切位点处的粘性末端,方向软件会自动识别。(当然这样画图谱我觉得挺麻烦的)

我一般直接将载体两酶切位点间其 ...

谢谢你的回复,不过按照你的这个操作了之后,片段的顺序仍旧是反的
4楼2012-03-01 14:23:31
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

引用回帖:
4楼: Originally posted by njyang2006 at 2012-03-01 14:23:31:
谢谢你的回复,不过按照你的这个操作了之后,片段的顺序仍旧是反的

你确定下,到底是基因箭头反了,还是基因序列反了。
Thank-you,so-blue.
5楼2012-03-01 17:05:29
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jasco

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我一般用别的软件例如dnastar之类把插入序列先做成反向互补的,然后跟3楼说的一样,在vectornti中直接插入就行了
6楼2012-03-02 14:29:55
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njyang2006

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by susizheng at 2012-03-01 17:05:29:
你确定下,到底是基因箭头反了,还是基因序列反了。

是pET28a的载体序列方向与基因的序列方向相反
7楼2012-03-02 16:45:26
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

引用回帖:
7楼: Originally posted by njyang2006 at 2012-03-02 16:45:26:
是pET28a的载体序列方向与基因的序列方向相反

插入之前先将目的基因reverse一下,
怎么会还相反呢?请问你确定你的基因reverse过了?
Thank-you,so-blue.
8楼2012-03-02 16:47:25
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寒亦乔51

新虫 (小有名气)

送红花一朵
请问楼主问题解决了么,我用NTI根本不知道怎么插入序列啊  求指教
10楼2016-03-18 11:36:49
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