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354929697

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教大家RNA电泳条带有弥散什么原因? 已有3人参与

我用trizol提的真菌总RNA,跑电泳。28s后面老是有拖带,是DNA,多糖,蛋白质污染还是因为RNA降解呀?  我原来一直以为是因为RNA降解,今天听一老师说28s后面的拖带是DNA污染,RNA如果降解都是降解成小片段,不会在28s后面的。到底什么原因?   该在什么地方再注意下吗?

请教大家RNA电泳条带有弥散什么原因?
电泳.jpg
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qapollo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
354929697(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-10 09:19:38
从图上看确实有污染,但不是你说的“弥散”。你这种情况应该是“拖尾”,也就是RNA降解,这和你的电泳槽有关,可能是没有去RNA处理过。你确实提出了DNA,就在胶孔下面一点点的位置的那条亮带,也不是什么大问题,除一下DNA就行了。这个质量的RNA做实验应该没问题,可以放心。
3楼2014-09-09 12:58:16
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354929697

铜虫 (初入文坛)

自顶一下~~   求哪位大神解释一下~~  最近很纠结这个问题的
2楼2014-09-09 10:25:19
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354929697

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by qapollo at 2014-09-09 12:58:16
从图上看确实有污染,但不是你说的“弥散”。你这种情况应该是“拖尾”,也就是RNA降解,这和你的电泳槽有关,可能是没有去RNA处理过。你确实提出了DNA,就在胶孔下面一点点的位置的那条亮带,也不是什么大问题,除 ...

谢谢你的帮助。   拖尾的原因是  RNA降解吗?  老师的解释 RNA降解 会降解成小片段,电泳时会跑到28s的前面,感觉也有点道理。电泳槽是专用的,电泳液也是depc处理过的水配的,不过用了有一段时间了。
4楼2014-09-10 09:30:56
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就会提核酸

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
354929697(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-10-04 22:17:03
拖尾不必然是基因组 DNA 残留,更多基因组 DNA 的残留同样可以跑出无拖尾的 RNA 带型。你样品中的多糖残留同样会导致拖尾。分层取上清后再用氯仿抽提一次,可以降低多糖残留。如果结合高盐沉淀试剂,会提出漂亮的 RNA 的。
5楼2014-10-01 14:21:33
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