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hj890509

金虫 (正式写手)

[求助] 连接转化问题 已有6人参与

表达载体连接片段转化后不长菌落,转质粒验证过感受态细胞没有问题,配置的平板也没有问题,表达载体用AvrII和SnaBI双酶切,一个是粘性末端,另一个是平末端,目的片段是用相同的酶从T载体上切下来回收的,载体9.3kb,目的片段4.4kb,摩尔比为1:3,1:5,1:8都做过,用NEB的T4连接酶22度连接2h后转化的,也做过其他时间,求各位虫友们帮忙分析分析,谢啦
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-02 15:27:10
hj890509: 金币+2, 有帮助 2014-09-03 10:23:21
亲,这个问题不是载体的问题,是表达菌落的问题,建议你换一种感受态试试。
也有人说转化时摇菌时间长一点,2个小时左右
连接时间也适当长一些
2楼2014-09-02 14:50:24
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普通回帖

111111111118

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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hj890509: 金币+5, 有帮助 2014-09-11 14:58:38
对于涉及到平末端的克隆, 建议你看看另一个帖子和相关论文:

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7727916

应该还是很有帮助的, 毕竟平末端克隆的难度大一些, 得需要点特殊处理, 希望能有帮助!
3楼2014-09-02 16:18:50
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huyan0817

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-03 18:46:01
hj890509: 金币+2, 有帮助 2014-09-11 14:59:01
平末端连接比较困难,除了加连接酶,整个体系里面还要加特殊Buffer!可以买点专门连接平末端酶!
4楼2014-09-02 17:22:34
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hj890509

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huyan0817 at 2014-09-02 17:22:34
平末端连接比较困难,除了加连接酶,整个体系里面还要加特殊Buffer!可以买点专门连接平末端酶!

我们之前连接的两端都是平末端的还好啊,是不是一端平末端一端粘性末端会更难连接?
5楼2014-09-03 09:43:43
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hj890509

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by happydove at 2014-09-02 14:50:24
亲,这个问题不是载体的问题,是表达菌落的问题,建议你换一种感受态试试。
也有人说转化时摇菌时间长一点,2个小时左右
连接时间也适当长一些

可是之前用该载体连别的基因,两边都是粘性末端的时候就很好连接啊,表达菌落应该没有问题。
6楼2014-09-03 10:23:10
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生物小学渣

新虫 (初入文坛)

亲,我也要用这两个酶做双酶切,麻烦问一下,你是用的什么体系,和时间?因为snabI酶里带了一份0.1%的BSA,可是avrII是没有的。我是新手,不知道怎么办了?谢谢
7楼2014-10-05 14:49:58
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zergbloody

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主建议你把质粒载体测浓度稀释至十几ng/微升 然后把前段按比例稀释十倍 五十倍 一百倍 再连接 用16度连接过夜 效果比较好

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2014-10-07 08:29:28
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zergbloody

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
hj890509: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-10-08 08:41:35
哦 对了 使用十微升体系 载体加0.5 片段加2即可 其他按量加 补水至10

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-10-07 08:31:22
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hj890509

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 生物小学渣 at 2014-10-05 14:49:58
亲,我也要用这两个酶做双酶切,麻烦问一下,你是用的什么体系,和时间?因为snabI酶里带了一份0.1%的BSA,可是avrII是没有的。我是新手,不知道怎么办了?谢谢

体系就按说明书里的,我用的是NEB的酶,用Cutsmart缓冲液,不需要加0.1%的BSA,酶切两个小时就够了
10楼2014-10-08 08:40:52
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