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chenyanzhen

铁虫 (小有名气)

[求助] 有引物序列,却找不到对应的目的序列 已有2人参与

在文献中找到两对引物序列,但是在ncbi-blast中却找不到其P的序列,哪位高手帮帮忙,急用!
PF1(5-3):-GTCTGGTAGCACTGCTTCA-
PR1(5-3):-GTCGGTTGCTGGTGCAAAA-
PF2(5-3):-GTCTGGTAGCACTGCTTCA-
PR2(5-3):-GTCGGTTGCTGGTGCAAAA-
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


【答案】应助回帖

第二条引物:

Karenia mikimotoi KMWL01 large subunit ribosomal RNA gene, partial sequence
Sequence ID: gb|EF469238.1|Length: 1453Number of Matches: 1
Related Information
Range 1: 782 to 800GenBankGraphics Next Match Previous Match
Alignment statistics for match #1 Score        Expect        Identities        Gaps        Strand
38.2 bits(19)         0.41         19/19(100%)         0/19(0%)         Plus/Minus

Query  1    GTCGGTTGCTGGTGCAAAA  19
            |||||||||||||||||||
Sbjct  800  GTCGGTTGCTGGTGCAAAA  782
7楼2014-08-04 20:53:57
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-08-04 14:08:50
我试了第一个,好像有的吗?是Karenia mikimotoi strain Daya Bay 18S ribosomal RNA gene?
你不妨再试试?
2楼2014-08-04 11:31:14
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chenyanzhen

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-04 11:31:14
我试了第一个,好像有的吗?是Karenia mikimotoi strain Daya Bay 18S ribosomal RNA gene?
你不妨再试试?

你i确定么?我用genesnap找到上游引物的序列,但是没有下游引物的。你是怎么找到 的?
活在当下,充实自己
3楼2014-08-04 13:07:55
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


引用回帖:
3楼: Originally posted by chenyanzhen at 2014-08-04 00:07:55
你i确定么?我用genesnap找到上游引物的序列,但是没有下游引物的。你是怎么找到 的?...

这里:
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
4楼2014-08-04 13:10:38
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