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hnsea

铜虫 (小有名气)

[求助] 细菌质粒提取及PCR 已有4人参与

如题,细菌用小提试剂盒提取质粒,浓度在几十至100ug/ml。
进行多个相关耐药基因(200-500bp)扩增并电泳检测,没有一个条带。marker(1000bp)也不亮,没完全分开。
是操作设计不好吗啊?
请分析下原因。
pcr条件如下:94度预热5-8min,94变性40S,Tm减5度退火40S,72度再延伸40s,重复30个循环,72度再延伸5min,4度保持。

琼脂糖电泳条件:1%的胶,120ev,120mA.
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zff922

金虫 (正式写手)

虽然看的晚了,但是还是忍不住说两句,首先楼主的水平太低了,另外回答者都是针对的一些细枝末节的地方挑毛病,也算是无病呻吟吧。首先有说电压的,有说PCR体系的还有说模版的。我都无语了,如果楼主用试剂盒抽质粒或者PCR都有问题,我真是要佩服了。按部就班的东西很少出错的,电压160V和100V跑出来的效果也不会差太多,胶做不好可以重复一下用MARKER做对照。
总之,我认为如果不是楼主失误的话,就是质粒很不就不是阳性质粒,你应该以菌落PCR先鉴定,而且引物要一个是目的基因的一个是vector上的通用引物。阳性的就可以摇菌抽质粒了。抽出来的质粒其实不需要再鉴定了,不过保险一点再鉴定也可以,模版0.2微升就可以。后面要是有问题就是初级水平的问题。至少是大学生水平不应该出的问题更别说研究生了。
每天都充实,有意义。
9楼2014-12-03 14:27:11
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songzuowei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hnsea(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-28 11:13:51
1.marker(1000bp)也不亮,说明你做的琼脂糖凝胶质量不好,要么是旧胶,要么是核酸染料太少
2.进行多个相关耐药基因一个也扩增不出来,原因本身有2:一是模板质量太差二是PCR体系存在问题,是否漏加了组分如dNTP等
2楼2014-07-28 09:37:50
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hnsea

铜虫 (小有名气)

非常感谢您的回复,请问我的模板浓度还行吗?成分是不会漏加的,做了好几轮呢。PCR程序设计没问题吧。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
当我哭泣我没有好看的鞋子时, 却发现有人连脚都没有。
3楼2014-07-28 09:51:01
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
hnsea(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-28 11:14:02
模板浓度大约20ng/ul就可以了。
琼脂糖电泳条件:1%的胶,90ev,25min试试看,如果没跑好,再加点时间。
4楼2014-07-28 10:51:00
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