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biology-girl

新虫 (正式写手)

[求助] RNA 反转录后 还有内含子? 已有4人参与

我是提取的RNA 做反转录,但是转录的片段测序后 发现和有内含子的序列,但是又不是完全有内含子,只是含有部分内含子的序列,请问这是说明内含子的位置网上预测的不准确 ? 还是我反转录的时候出了什么问题,跑RNA 的时候没有发现DNA带呀!!!
PS: NCBI 上的CDS 区 是分段的是不是说明中间的空格基因就是内含子序列?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
反转的时候用的是oligodT还是随机引物?
9楼2014-05-29 22:20:43
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by biology-girl at 2014-05-29 22:52:03
用的oligodT...

那应该是可变剪接
12楼2014-05-29 23:47:21
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by biology-girl at 2014-05-30 15:06:04
这种情况 是要重新做吗?...

我觉得可以多挑些克隆测序,看下测序结果是不是存在可变剪接。

[ 发自小木虫客户端 ]
14楼2014-05-30 22:37:10
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