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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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biology-girl

新虫 (正式写手)

[求助] RNA 反转录后 还有内含子? 已有4人参与

我是提取的RNA 做反转录,但是转录的片段测序后 发现和有内含子的序列,但是又不是完全有内含子,只是含有部分内含子的序列,请问这是说明内含子的位置网上预测的不准确 ? 还是我反转录的时候出了什么问题,跑RNA 的时候没有发现DNA带呀!!!
PS: NCBI 上的CDS 区 是分段的是不是说明中间的空格基因就是内含子序列?
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谁呀你是谁呀

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-29 23:02:10
选择性拼接造成的
内含子本身就是相对的 剪掉了 就是内含子 没剪掉就是外显子了
等等等等
8楼2014-05-29 19:28:56
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Neo2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可能是可变剪切,也可能是预测出错了,这个很正常

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2014-05-29 19:21:15
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普通回帖

biology-girl

新虫 (正式写手)

帮自己顶一下。希望更多的人参与!!!!
2楼2014-05-29 18:44:02
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-05-29 20:34:52
在NCBI里搜索你想要的基因序列,最好不要用Nucleotide,从这里面一堆垃圾中找到你想要的,真的与捞针差不多。
选 择GENE和UNIGENE,这两个都可以,去查,然后再后面找到你所要的物种。后面的链接,自己点开就可以了。
complete cds 即完全编码区,当然是只有外含子了,而且是完整阅读框,如果序列性质是mRNA,就不含内含子。
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
3楼2014-05-29 18:46:22
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biology-girl

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-29 18:46:22
在NCBI里搜索你想要的基因序列,最好不要用Nucleotide,从这里面一堆垃圾中找到你想要的,真的与捞针差不多。
选 择GENE和UNIGENE,这两个都可以,去查,然后再后面找到你所要的物种。后面的链接,自己点开就可以了 ...

我找到基因的 mRNA序列了,不过我克隆的基因还是比他多了些基因。
4楼2014-05-29 19:03:59
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by biology-girl at 2014-05-29 19:03:59
我找到基因的 mRNA序列了,不过我克隆的基因还是比他多了些基因。...

一模一样就不对了,上传不到NCBI,这才能说明你的材料具有本地特色
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
5楼2014-05-29 19:08:34
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biology-girl

新虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-29 19:08:34
一模一样就不对了,上传不到NCBI,这才能说明你的材料具有本地特色...

6楼2014-05-29 19:16:14
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
反转的时候用的是oligodT还是随机引物?
9楼2014-05-29 22:20:43
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biology-girl

新虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-29 22:20:43
反转的时候用的是oligodT还是随机引物?

用的oligodT
10楼2014-05-29 22:52:03
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