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子鱼默默

铁虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 28
在线: 4.6小时
虫号: 1960355
注册: 2012-08-28
性别: MM
专业: 微生物生理与生物化学

[求助] 系统发育树中比对序列怎么选的？？在哪里选。。已有1人参与

如题，，我16sRAN菌株鉴定后得到一条序列后在NCBI上BASTE比对后获得十几条同源性99%序列但是在Med4上构建的系统发育时获得的相似性很小。。我就觉得是比对序列找错了。。但是我不知道怎么找。。跪求帮助

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1楼 2014-05-09 21:50:12

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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

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专业: 金属材料表面科学与工程

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

http://www.ezbiocloud.net/ 用这个吧，NCBI太多无效序列了

赞一下(1人)

但行好事，莫问前程

3楼2014-05-12 09:49:08

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查看全部 3 个回答

baishijie

铁虫 (初入文坛)

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专业: 微生物学

你不会是和人的去比了吧，如果排除数据库选择问题，那很可能是新种啊！

2楼2014-05-10 21:29:51

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