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系统发育树中比对序列怎么选的??在哪里选。。
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子鱼默默
铁虫
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注册: 2012-08-28
性别:
MM
专业: 微生物生理与生物化学
[
求助
]
系统发育树中比对序列怎么选的??在哪里选。。
已有1人参与
如题,,我16sRAN菌株鉴定后得到一条序列后在NCBI上BASTE比对后获得十几条同源性99%序列但是在Med4上构建的系统发育时获得的相似性很小。。我就觉得是比对序列找错了。。但是我不知道怎么找。。跪求帮助
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1楼
2014-05-09 21:50:12
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baishijie
铁虫
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虫号: 596248
注册: 2008-09-09
专业: 微生物学
你不会是和人的去比了吧,如果排除数据库选择问题,那很可能是新种啊!
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2楼
2014-05-10 21:29:51
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20093651
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注册: 2010-12-23
专业: 金属材料表面科学与工程
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
http://www.ezbiocloud.net/
用这个吧,NCBI太多无效序列了
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但行好事,莫问前程
3楼
2014-05-12 09:49:08
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