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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 求大牛指导构建真菌系统发育树！比对结果比较杂乱，不知道选择那一株做外源基因啊
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omnifat

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大牛指导构建真菌系统发育树！比对结果比较杂乱，不知道选择那一株做外源基因啊 已有3人参与

求大牛指导！！！！！！


金币不多，略表心意！！！

略抓狂啊啊啊啊啊
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1楼 2014-05-04 16:41:33
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-04 23:46:37
查一些比对结果和你的菌的种属相似的论文，看别人怎样选外标。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2014-05-04 17:44:18
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omnifat

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2014-05-04 17:44:18
查一些比对结果和你的菌的种属相似的论文，看别人怎样选外标。

可以留个联系方式吗 方便咨询下
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3楼2014-05-04 21:06:24
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
引用回帖:
3楼: Originally posted by omnifat at 2014-05-04 21:06:24
可以留个联系方式吗 方便咨询下...

不用啊，你就找论文看就行了，外标的序列应该有NCBI的序列号的，你找就能找得到。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2014-05-04 21:30:39
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
omnifat: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-05-08 14:12:25
选择进化距离最远的
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5楼2014-05-05 07:45:28
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
参考论坛内关于构建进化树的帖子，让别人帮你做就要看运气啦~而且学到手不是更好，这很简单的~相比于其他难的问题~
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6楼2014-05-05 08:10:47
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omnifat

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wizardfan at 2014-05-05 07:45:28
选择进化距离最远的

你好 ，比对结果只有六七种属于一个属。其他的都不大一样。构建的结果是偏向外标。这样的话，怎么破？
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7楼2014-05-05 08:36:22
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
omnifat: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2014-05-08 14:13:06
引用回帖:
7楼: Originally posted by omnifat at 2014-05-05 08:36:22
你好 ，比对结果只有六七种属于一个属。其他的都不大一样。构建的结果是偏向外标。这样的话，怎么破？...

如果你只关心那属于同一属的六七种的话，outgroup可以选择所有其他的，同时删除掉几个。
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8楼2014-05-05 08:48:33
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omnifat

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wizardfan at 2014-05-05 08:48:33
如果你只关心那属于同一属的六七种的话，outgroup可以选择所有其他的，同时删除掉几个。...

删掉的几个是哪一集合里的？ outgroup吗 大神？
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9楼2014-05-05 08:53:30
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主
引用回帖:
9楼: Originally posted by omnifat at 2014-05-05 08:53:30
删掉的几个是哪一集合里的？ outgroup吗 大神？...

当然了，反正他们的作用不大。你可以考虑一个属一个，这样的话，进化距离就比较明显。
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10楼2014-05-05 19:29:35
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