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gdpn900至尊木虫 (著名写手)
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【求助/交流】请教clustal 多重序列比对出现的问题 已有3人参与
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现在要将11个氨基酸序列进行比对， 由于这个蛋白的氨基酸序列的N端存在着3段具有较高相似性的重复序列， 在哺乳动物中发现的这个蛋白是存在3个这样的重复序列，假设为A、B、C， 在非哺乳动物中目前发现的仅仅有第三个重复序列，C， 由于这三个序列存在着相似性，所以将非哺乳动物的序列去和哺乳动物的比对时， 非哺乳动物的C可能和A或者B就开始配对上，而不会对应到C上， 这样一来比对就导致产生与之前一些结论不同的结果。 到底该如何解决呢？ 不知道能不能理解清楚我讲的意思 |
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2楼2010-07-10 11:53:17
gdpn900
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6楼2010-07-13 00:06:28