| 查看: 4179 | 回复: 3 | ||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | ||||
seamas_gao2新虫 (小有名气)
|
[求助]
求怎么用clustal比对序列，得出相似度？
|
|||
| 小弟手头上有一个样品序列，然后还有一堆库存序列。我想比对一下样品序列跟哪个库存序列最相似，还要知道相似度是多少。请问怎样用软件实现，请尽量说的详细点，本人新手，十分感谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 | 生信 |
» 猜你喜欢
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有125人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 现在大家比对序列除了NCBI还有用哪些网站？
已经有11人回复
- 序列比对，相似性
已经有7人回复
- 序列比对不上？怎么办？
已经有7人回复
- 有人知道如何编辑clustal序列比对产生的aln文件吗？
已经有5人回复
- 【求助/交流】在用clustal 多序列对比时……求助！！！
已经有5人回复
- 【求助/交流】请教如何使用Clustalw进行多序列比对？
已经有7人回复
- 【求助/交流】请教clustal 多重序列比对出现的问题
已经有5人回复
gyesang
荣誉版主 (著名写手)
-
专家经验: +24 - MolEPI: 31
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 2.689
- 金币: 24339.7
- 散金: 1088
- 红花: 88
- 沙发: 2
- 帖子: 2327
- 在线: 623.1小时
- 虫号: 849017
- 注册: 2009-09-16
- 性别: GG
- 专业: 细胞信号转导
- 管辖: 分子生物
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2012-12-09 17:40:52
amisking: 金币+5, MolEPI+1, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2012-12-09 17:41:03
seamas_gao2: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 十分感谢！ 2012-12-10 16:01:29
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2012-12-09 17:40:52
amisking: 金币+5, MolEPI+1, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2012-12-09 17:41:03
seamas_gao2: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 十分感谢！ 2012-12-10 16:01:29
|
我来尝试回答下你的问题，希望对你有用！ 第一步：打开在线版的clustx http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/，把序列贴进去，进行比对，如下图  然后比对结果如下：  第二步，点击那个summary，进入下图  假设你的序列是1，与2，3，4 两两比较，就知道与谁最相似了 祝实验顺利！ [ Last edited by gyesang on 2012-12-19 at 23:53 ] |
4楼2012-12-09 15:55:10
2楼2012-12-08 21:57:52
seamas_gao2
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1764.5
- 散金: 10
- 帖子: 182
- 在线: 66.6小时
- 虫号: 1879384
- 注册: 2012-07-05
- 专业: 水产养殖学
3楼2012-12-09 09:53:53
50