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seamas_gao2新虫 (小有名气)
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求怎么用clustal比对序列,得出相似度?
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| 小弟手头上有一个样品序列,然后还有一堆库存序列。我想比对一下样品序列跟哪个库存序列最相似,还要知道相似度是多少。请问怎样用软件实现,请尽量说的详细点,本人新手,十分感谢! |
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gyesang
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2012-12-09 17:40:52
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seamas_gao2: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 十分感谢! 2012-12-10 16:01:29
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我来尝试回答下你的问题,希望对你有用! 第一步:打开在线版的clustx http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/,把序列贴进去,进行比对,如下图 然后比对结果如下: 第二步,点击那个summary,进入下图 假设你的序列是1,与2,3,4 两两比较,就知道与谁最相似了 祝实验顺利! [ Last edited by gyesang on 2012-12-19 at 23:53 ] |

4楼2012-12-09 15:55:10

2楼2012-12-08 21:57:52
seamas_gao2
新虫 (小有名气)
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