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各位学长、学姐帮帮忙,PCR只有引物二聚体
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韩元富豪
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专业: 微生物生理与生物化学
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各位学长、学姐帮帮忙,PCR只有引物二聚体
已有11人参与
设计的一对引物,Tm值分别是72℃、67.2℃,尝试的温度有66℃、65℃、64℃、63℃、62℃,但都只有引物二聚体,怎么办,(先前提模板DNA时有条带,但PCR的时候就只有引物二聚体了),已经做了好长时间了,怎么办,求指点
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1楼
2014-05-05 11:02:08
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zhaodahe
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【答案】应助回帖
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韩元富豪: 金币+2, 谢谢啦,我再试试
2014-05-09 13:06:58
韩元富豪: 金币+2,
★★★
很有帮助
2014-05-10 13:12:04
不知道引物多长,但是我觉得退火温度太高了,我一般都用54-56度;60度以上就是很难扩增出来。
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8楼
2014-05-06 15:13:36
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zep616745243
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2014-05-05 15:55:49
确保模板没有问题的前提下,可以试试降低退火温度吧,真不行就换引物吧
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只有不断地失败才会成功
2楼
2014-05-05 12:26:24
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BioChen
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专业: 生物信息学
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2014-05-05 15:55:56
你的模版是什么?基因组?
基因组DNA变性有点困难,可以考虑加DMSO。
把退火温度降到50度,看看有没有条带。如果没有条带果断换模版与引物。如果有带,继续优化PCR条件。
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3楼
2014-05-05 12:34:25
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3楼
:
Originally posted by
BioChen
at 2014-05-05 12:34:25
你的模版是什么?基因组?
基因组DNA变性有点困难,可以考虑加DMSO。
把退火温度降到50度,看看有没有条带。如果没有条带果断换模版与引物。如果有带,继续优化PCR条件。
模板是解淀粉芽孢杆菌中的pyrr基因,设计了两组引物:上游同源臂和下游同源臂,PCR的时候都只是引物二聚体,查看了这 个种的所有pyrr基因,在设计引物的那个片段,只有一个碱基不一样,其他都一样,下游同源臂引物未加被保护碱基和酶切位点的时候Tm是65.6和64.3,加了之后变成了72,67.2 。那Tm值多少合适呢
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4楼
2014-05-05 14:28:12
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