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我叫李四

金虫 (正式写手)

[求助] 同一菌种用细菌和真菌引物都跑出了条带,谁能给解释一下? 已有3人参与

第一孔为2k marker
第二孔为 阴性对照
第三四五孔为同一菌株,
            分别用的细菌和真菌引物,结果都有条带
            哪位能给解释一下啊??

同一菌种用细菌和真菌引物都跑出了条带,谁能给解释一下?
5.1 PCR产物电泳图.png
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性别男身高175cm体重70kg
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DoRbIr

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也觉得阴性对照里已经有污染了,你阴性对照加的是真菌引物吧?有没有细菌引物的阴性对照啊。
8楼2014-05-02 22:30:38
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先阴性都有条带肯定是DNA有污染,目标菌真菌还是细菌?引物都是通用引物?
学习使你立于不败之地
2楼2014-05-01 22:56:45
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我叫李四

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-05-01 22:56:45
首先阴性都有条带肯定是DNA有污染,目标菌真菌还是细菌?引物都是通用引物?

阴性对照里面都没加DNA样品,只加了PCR mix 超纯水,和真菌ITS引物
目标菌是什么还没鉴定呢,
细菌引物 1492r和27  真菌用的ITS引物,都是通用引物
性别男身高175cm体重70kg
3楼2014-05-02 08:21:16
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你那个在同一位置上出现的条带可能是DNA污染也有可能点样飘了。细菌和真菌通用引物反应条件不一样,细菌至少1.5min去延伸,真菌1min足够了,还有要考虑循环次数这些都有可能增加杂带可能。
学习使你立于不败之地
4楼2014-05-02 09:50:24
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