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xiayu608

禁虫 (小有名气)

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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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xiayu608: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-04-25 09:52:01
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-25 10:53:56
cDNA的浓度几乎无法测定的,你可以通过做标准曲线测试你的扩增效率,你的内参基因是否恰当都要考虑的,建议你查下MIQE标准。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-04-24 18:54:28
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rodickholm

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiayu608: 金币+2, 有帮助 2014-04-25 10:47:48
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-25 10:54:01
测RNA浓度即可,cDNA无法测定的
3楼2014-04-25 10:05:03
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xiayu608

禁虫 (小有名气)

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4楼2014-04-25 10:47:33
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xiayu608

禁虫 (小有名气)

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5楼2014-04-25 10:48:59
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiayu608 at 2014-04-25 10:48:59
为什么不可以测定?...

你的cDNA里面还有很多未转录的RNA,你觉得测定的值准吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-04-25 11:54:23
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fanwq258

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cDNA含量怎么测定?你纯化过了?如果未纯化,里边含有rna,dNTP等,影响很大
要么好好活,要么死,拒绝半死不活
7楼2014-04-27 19:51:04
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xiayu608: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-29 09:13:00
前两天见人做个RT-PCR,最后跑胶,竟然上一个cDNA,不知道他想看什么,而且看他那RNA残留的量,RT还给了不少RNA。今天又看到一个cDNA定量的。。。
没有什么东西是不能定量的,你也确实定量了,你测RT产物,不是还是得到了一个A260数值么?
问题是你要明白你定的是什么东西??
RT之后,系统中存在模板RNA,你给的引物,不管是oligodT还是Random primer,或者gene-specific primer,还有dNTP。
你没觉得这些东西在A260处都有光吸收么?
你再想想,你的RT产物,cDNA,化学上从何而来?
不就是从dNTP来的么?
这不就相当于是一个与外界隔离的系统,物质的质量该守恒吧?
根据“减色效应”,dNTP的光吸收能力远远强于polydNTP,也就是你的cDNA,如果以A260值为指标,你可以发现这个系统的总A260值在反应前后还会下降。当然,严谨的,你还要考虑Reverse Transcriptase的RNaseH活性,如果这个活性足够强,dNTP每掺入一些到cDNA中,就有一些RNA降解为NTP,A260值可能不变,当然,RNaseH活性不会这么强。
说这么多,就是告诉你下次干这个的时候,要想想你到底在干啥!
我实验室曾经有人试图用A260检测in vitro transcription的RNA得率,跟你这个都错在一个地方。


最后回过来,刚才讨论的其实都是很细微的方面,
即便是你试图测A260这个不对,如果你发现你RT做完之后,A260值在管见相差很大,这也是不太对的。因为这个系统中对A260影响最大的是RNA和dNTP,这两个都是你按一定量给的,如果你发现相差很大,说明你配样的时候误差很大。
8楼2014-04-27 22:26:32
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邹忌

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


xiayu608: 金币+1, 有帮助 2014-04-29 09:11:06
基本上都会测RNA 的含量,然后根据其含量来进行标准的稀释达到你想要的浓度
不是不能,只是不想
9楼2014-04-28 10:09:15
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