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寂寞又美好

金虫 (小有名气)

[求助] 测序测不出来,求高手解答 已有6人参与

各位前辈们,本人前端时间克隆了两个基因但是总是测不出来,求解答。菌液PCR验证的图和我胶回收的图是一致的,但是测了两次都没测出来、。
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:04
载体构建,没有没切验证的话,谈何测序?
2楼2014-03-07 21:49:42
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踏实的心

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:09
可能菌液抗性存在问题,我之前去华大测序就摇不起来,但在我们实验室就可以摇起来,后来发现抗生素有问题
3楼2014-03-08 08:14:44
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蒙古狐狸

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:14
建议酶切,看看条带是否正确,PCR可能会有假阴性问题
4楼2014-03-08 09:13:51
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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:20
测不出来指的是测序结果没有插入序列,还是测序失败?
如果是前者,那就是克隆错了,聚落PCR的阳性结果可能是由于模版污染了PCR体系造成的。建议重做。
如果是后者,我建议你先换个公司试试吧。有的公司测序质量和实验条件是有欠缺的。

希望对你有帮助。
5楼2014-03-08 09:35:16
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:26
序列里有高级结构也会影响测序,再一个一个公司测不出来再换一家试试,有时我们在华大测不好换了博尚就好了。
hehe
6楼2014-03-08 10:00:39
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-08 12:42:31
1,你进行过酶切验证没?如果没有,很有可能是没克隆成功

2,如果对方公司测序测出来是空载,那么也是没克隆成功

3,如果测序终止或者无法进行,那应该是你的序列里含有高级结构,无法进行测序

建议验证克隆成功以及pcr引物测序
天行健
7楼2014-03-08 11:46:57
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我很快乐3A87

新虫 (小有名气)

我也是这样的问题,老是测序失败,都失去信心了!
只为自己所要的幸福快乐
8楼2014-03-08 13:33:38
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