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测序测不出来,求高手解答
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寂寞又美好
金虫
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测序测不出来,求高手解答
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各位前辈们,本人前端时间克隆了两个基因但是总是测不出来,求解答。菌液PCR验证的图和我胶回收的图是一致的,但是测了两次都没测出来、。
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1楼
2014-03-07 21:34:33
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Lau_Kimura
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2014-03-08 12:42:04
载体构建,没有没切验证的话,谈何测序?
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2楼
2014-03-07 21:49:42
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2014-03-08 12:42:09
可能菌液抗性存在问题,我之前去华大测序就摇不起来,但在我们实验室就可以摇起来,后来发现抗生素有问题
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3楼
2014-03-08 08:14:44
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蒙古狐狸
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2014-03-08 12:42:14
建议酶切,看看条带是否正确,PCR可能会有假阴性问题
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4楼
2014-03-08 09:13:51
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lihe131
至尊木虫
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2014-03-08 12:42:20
测不出来指的是测序结果没有插入序列,还是测序失败?
如果是前者,那就是克隆错了,聚落PCR的阳性结果可能是由于模版污染了PCR体系造成的。建议重做。
如果是后者,我建议你先换个公司试试吧。有的公司测序质量和实验条件是有欠缺的。
希望对你有帮助。
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5楼
2014-03-08 09:35:16
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lvbobo823
铁杆木虫
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2014-03-08 12:42:26
序列里有高级结构也会影响测序,再一个一个公司测不出来再换一家试试,有时我们在华大测不好换了博尚就好了。
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hehe
6楼
2014-03-08 10:00:39
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youlinglyw
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kx444555: 金币+3, 鼓励交流
2014-03-08 12:42:31
1,你进行过酶切验证没?如果没有,很有可能是没克隆成功
2,如果对方公司测序测出来是空载,那么也是没克隆成功
3,如果测序终止或者无法进行,那应该是你的序列里含有高级结构,无法进行测序
建议验证克隆成功以及pcr引物测序
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天行健
7楼
2014-03-08 11:46:57
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我很快乐3A87
新虫
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专业: 植物化学保护
我也是这样的问题,老是测序失败,都失去信心了!
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只为自己所要的幸福快乐
8楼
2014-03-08 13:33:38
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