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Illfxy

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】质粒测序没结果,希望高手们解答! 已有8人参与

小弟,最近在做菌种鉴定,把质粒送到公司测序,结果是好几个重头到尾都读不出,有几个又是到了五六百了就不能读不出了。头一做,就搞成这样。希望大侠们解答!谢谢了!
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探索人类未来的其中一人
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

测出来的图

探索人类未来的其中一人
2楼2010-08-23 15:00:00
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

探索人类未来的其中一人
3楼2010-08-23 15:00:30
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个图好像套峰很严重啊,通用引物用的什么啊?
4楼2010-08-23 15:33:27
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
弱弱的问一句……质粒是不是纯的啊……
5楼2010-08-23 16:06:23
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周_yan

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可能是你质粒不是很好,菌的活力不高提的质粒不是很好,测序时信号不强。而到670bp后就没有也可能是测序公司的一个测序反应就能测这么多可以考虑多测个反应然后测通,我也遇到过这种情况。可以再挑个克隆重新测。
6楼2010-08-23 16:38:20
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by Illfxy at 2010-08-23 15:00:30:

用的M13的引物,这个会有影响吗?
探索人类未来的其中一人
7楼2010-08-23 16:44:11
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 周_yan at 2010-08-23 16:38:20:
可能是你质粒不是很好,菌的活力不高提的质粒不是很好,测序时信号不强。而到670bp后就没有也可能是测序公司的一个测序反应就能测这么多可以考虑多测个反应然后测通,我也遇到过这种情况。可以再挑个克隆重新测。

谢谢你的回复,我准备重新挑菌做了。
探索人类未来的其中一人
8楼2010-08-23 16:46:34
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Illfxy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-08-23 16:06:23:
弱弱的问一句……质粒是不是纯的啊……

我也是这么想的,但是还是觉得即便有污染也不该这样吧,怎么有的前半段没有特别多的重叠,后半段都测不出
探索人类未来的其中一人
9楼2010-08-23 16:50:31
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+1): 2010-08-23 21:02:21
恩,多挑一点克隆,只要有重叠就不太准确,你这是质粒啊,又不是PCR产物。。
10楼2010-08-23 16:54:18
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