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qingtian510

银虫 (初入文坛)


[交流] 蛋白跑出水盒子外边了

有人跑Gromacs,蛋白或其他东西,跑出盒子外的情况吗,这是怎么回事呢
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fangsteel

木虫 (正式写手)


★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-21 15:21:41
一般都会设置周期性边界条件
2楼2013-11-21 12:45:22
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iovvoi

金虫 (小有名气)


★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-21 15:21:46
周期性边界条件的话,跑出去也没关系 。
3楼2013-11-21 13:45:53
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hanhan1020

木虫 (正式写手)


★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-21 15:21:53
没事  反正都是周期性的。你可以把时间调低点,这样就出不去了
4楼2013-11-21 13:51:46
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hanhan1020

木虫 (正式写手)


5楼2013-11-21 13:52:11
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qingtian510

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2013-11-21 12:45:22
一般都会设置周期性边界条件

恩,设置周期边界条件了
6楼2013-11-21 18:59:35
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qingtian510

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
3楼: Originally posted by iovvoi at 2013-11-21 13:45:53
周期性边界条件的话,跑出去也没关系 。

恩,晓得了,谢谢
7楼2013-11-21 19:00:13
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qingtian510

银虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by hanhan1020 at 2013-11-21 13:51:46
没事  反正都是周期性的。你可以把时间调低点,这样就出不去了

时间调低点,你的意思是值跑的时间短点,还是df设置的小点
8楼2013-11-21 19:01:22
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taoyunwen

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 编辑内容 2013-12-15 09:38
月只蓝: 金币-20, 最后一次警告! 2013-12-15 09:38:54
月只蓝: 违规存档 2013-12-15 09:39:12
本帖内容被屏蔽

9楼2013-12-15 00:56:58
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29050801

新虫 (小有名气)



qingtian510(金币+1): 谢谢参与
我的也是
本来大分子在水环境
这样
出去的就没有水了啊
不知道有什么办发么
10楼2013-12-18 20:18:10
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