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qingtian510

银虫 (初入文坛)

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[交流] 蛋白跑出水盒子外边了

有人跑Gromacs，蛋白或其他东西，跑出盒子外的情况吗，这是怎么回事呢

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1楼 2013-11-21 09:54:35

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fangsteel

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★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 15:21:41

一般都会设置周期性边界条件

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2楼2013-11-21 12:45:22

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iovvoi

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★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 15:21:46

周期性边界条件的话，跑出去也没关系。

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3楼2013-11-21 13:45:53

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hanhan1020

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★ ★
qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 15:21:53

没事反正都是周期性的。你可以把时间调低点，这样就出不去了

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4楼2013-11-21 13:51:46

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hanhan1020

木虫 (正式写手)

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呵呵

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5楼2013-11-21 13:52:11

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qingtian510

银虫 (初入文坛)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by fangsteel at 2013-11-21 12:45:22
一般都会设置周期性边界条件

恩，设置周期边界条件了

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6楼2013-11-21 18:59:35

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qingtian510

银虫 (初入文坛)

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引用回帖:

3楼: Originally posted by iovvoi at 2013-11-21 13:45:53
周期性边界条件的话，跑出去也没关系。

恩，晓得了，谢谢

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7楼2013-11-21 19:00:13

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qingtian510

银虫 (初入文坛)

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引用回帖:

4楼: Originally posted by hanhan1020 at 2013-11-21 13:51:46
没事反正都是周期性的。你可以把时间调低点，这样就出不去了

时间调低点，你的意思是值跑的时间短点，还是df设置的小点

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8楼2013-11-21 19:01:22

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taoyunwen

禁虫 (小有名气)

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qingtian510(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 编辑内容 2013-12-15 09:38
月只蓝: 金币-20, 最后一次警告！ 2013-12-15 09:38:54
月只蓝: 违规存档 2013-12-15 09:39:12

本帖内容被屏蔽

9楼2013-12-15 00:56:58

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