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猫di阁楼

铜虫 (初入文坛)

[求助] 平末端加A尾连接T载体的问题 已有4人参与

各位亲,打搅了

我现在有一段融合片段想要连接T载体,用的是primer star所以产物是平末端,因为同学都反应平末端连接效率低,所以想加A尾巴再连接T载体。

加A尾时用的是TAKARA的DNA A-Tailing Kit,加A尾的体系如下:

buffer    5微
dNTP     4微
A-Tailing enzyme   0.5微
平末端DNA片段      约600ng(试剂盒的要求是达到0.5~5微克)
水          up  to 50微

我的片段长度有3740bp,与T载体连接时间为:16度2个半小时。

转入DH5a后,在氨苄蓝白斑平板上筛选到白色的菌落进行菌落PCR、提质粒、酶切验证。
酶切的结果不理想,空载体的大小为2692bp,酶切得到的片段大小为3500bp左右,我想问的是:
1.有人说连接的片段大于载体的大小会很难连,是这样吗?
2.酶切结果好像是只连上了一部分,是否是16度的反应时间太短?(说明书上写“长片段(2kb以上)进行克隆时,连接反应请延长至数小时。”咨询了TAKARA,说3740的片段要连多长时间,回复说不要超过3个小时。)
3.平末端连接是否还有更好的方法或者是经验,对于4000bp左右的平末端片段,怎样更有效的连上载体呢?

谢谢各位。
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ytetyio09

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-08 20:06:08
可以试试这篇论文的方法,虽然是个小的改进,但是值得一试,而且很方便:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24613256
7楼2014-03-25 18:53:52
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