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963979587

银虫 (初入文坛)

[求助] 实时荧光定量pcr，cDNA的加入量会影响结果的准确度吗？

大家好，最近一直做荧光定量pcr，20ul体系中3ug的rna反转录得到的cDNA，取4ul作为pcr的模板，10ul EvaGreen，4ul引物，2ulRNas水，这个体系可以得到挺好的结果，但是溶解曲线的温度在77°，不知道是不是引物二聚体，而且我觉得模板的量加的太多了，实验不能重复，一次就用光了，不知道是不是应该稀释一下？
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1楼 2013-10-14 15:54:30
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963979587

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by asr at 2013-10-15 15:51:55
OD260/OD230都在1以下 这个说明什么？

你的RNA浓度是多少？ 一般反转录要求的模板量试剂盒会有要求的。...

rna浓度是500ng/ul,OD值在1以下好像是有胍盐的污染，或者是乙醇没处理干净，反转录的试剂是按要求来的，但是cDNA的浓度我没办法确定，看着说明书好像是几十ng，但是我还能按我的那个模板量跑出平台期就觉得比较奇怪，模板量这么多，做的结果没有感觉很不对，但是重现性好差。不知道是什么原因？
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7楼2013-10-15 22:01:58
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-10-15 10:27:19
你的模板用量不是一般的大。通常情况下是用1μg RNA反转录后稀释5倍后取1μl做模板。把熔解曲线图发上来看看。CT值是多少？是否在15-30之间？
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2楼2013-10-14 22:31:01
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asr

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-10-15 10:27:28
20ul体系中3ug的rna反转录得到的cDNA，取4ul作为pcr的模板  

量明显太高了，先摸摸条件呀
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思想极度邪恶，勿怕勿怪！\(^o^)/~
3楼2013-10-14 23:29:42
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963979587

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-14 22:31:01
你的模板用量不是一般的大。通常情况下是用1μg RNA反转录后稀释5倍后取1μl做模板。把熔解曲线图发上来看看。CT值是多少？是否在15-30之间？

目的基因VCAM的CT值在25个循环左右，GAPDH在19个循环这儿，基本上都有平台期，
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4楼2013-10-15 10:20:26
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