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liulugang

木虫 (小有名气)

[求助] 求问44bp线性片段PCR,设计引物时需要注意什么?

求问,44bp长的线性片段PCR扩增,设计引物时需要特别注意什么?
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香分子生物期待你的精彩 2013-09-26 00:05:48
P什么,不直接合成引物然后退火?
行至水穷处,坐看云起时
2楼2013-09-25 20:36:24
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子非鱼花儿开

新虫 (初入文坛)

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★ ★
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liulugang: 金币+1, 有帮助 2013-09-26 16:25:07
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-27 15:58:28
这么短的还真没做过,最短的做过60bp的,相对还是比较好扩的。另外两个引物接到一块儿都能扩出来,44bp问题应该不会很大,相对于长片段应该容易一些
3楼2013-09-26 16:12:29
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liulugang

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pennchem at 2013-09-25 20:36:24
P什么,不直接合成引物然后退火?

组成型启动子
4楼2013-09-26 16:24:35
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-28 02:02:59
直接合成吧,太短了,引物二聚体和产物无法分开。就是一对44bp的引物,直接退火
5楼2013-09-27 15:44:53
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liulugang

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-09-27 15:44:53
直接合成吧,太短了,引物二聚体和产物无法分开。就是一对44bp的引物,直接退火

片段是合成的,浓度太低,所以想PCR一下
6楼2013-09-27 16:27:29
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hl16010921

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-27 21:22:47
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-28 02:03:15
引用回帖:
6楼: Originally posted by liulugang at 2013-09-27 16:27:29
片段是合成的,浓度太低,所以想PCR一下...

引物长度就得20bp左右,实际只增加了1倍的DNA量(引物的量和合成的双链等摩尔)或4倍(等OD值)这是理论产量,实际达不到。为了不到4倍的产量冒不纯的风险,犯不上吧。
7楼2013-09-27 19:49:21
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feilinshiji

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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大哥别P了,直接合成吧
8楼2013-09-27 20:58:17
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liulugang

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by feilinshiji at 2013-09-27 20:58:17
大哥别P了,直接合成吧

片段是合成的,浓度太低,所以想PCR一下..
9楼2013-09-28 00:07:46
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白菜吃虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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直接连到到载体上,要多少有多少啊
10楼2013-09-28 00:28:24
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