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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 酶切连接 （难题一个接一个呀）
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33ggdf

新虫 (小有名气)

[求助] 酶切连接 （难题一个接一个呀）

我在做Sac1和Xho1的双酶切连接（这两个酶切位点应该没啥问题吧 ？），分别用这两个酶对表达载体和T载体进行双酶切过夜（NEB的酶 标注说过夜不会产生星活性），T载体上我还加了保护碱基，然后分别切胶回收表达载体的大片段和T载体上的目的片段（两个片段都很亮，大小也合适，大片段约16k，目的片段1100bp）,大片段浓度是150纳克/微升，小片段是33纳克/微升，然后做连接（连接是用的NEB的普通连接酶，16度16小时），共20微升体系（1微升连接酶，连接酶我用的是新的;2微升10×连接buffer，也换过新的; 共做了三个比例即大片段与目的片段两者的摩尔比是1:6  1:10   和1:15），再进行热击转化涂皿，分别做了阳性对照（很多单菌落）和阴性对照（无单菌落）可以证明感受态及转化过程没问题，双酶切也成功。可为什么我的连接反应却一个单菌落也长不出来呢（抗性和浓度也没问题），哪位高人帮帮忙？？？最近快烦死了。。。。。
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1楼 2013-08-31 16:05:27
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yan.007133

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:25
33ggdf: 金币+2 2013-09-06 14:50:59
转化后没有克隆长出，说明载体已经全切开，转化的阴性对照也没问题话，可能是连接的问题，或者片段没切好
以下几点注意一下
1、NEB SacI、XhoI的建议buffer：Digest in CutSmart™ Buffer at 37°C.
2、时间的话NEB2-3h即可，时间太长不好，回切乱
3、片段是否设有保护碱基？
4、可以再少加点载体，多加些片段进去
再试一次，应该能成功
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9楼2013-09-02 19:13:47
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suhsia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-08-31 18:20:44
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:37
换个人做一下就行了，克隆这东西手气很重要，没设么技术含量的

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2013-08-31 16:23:24
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cr507

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
33ggdf: 金币+1 2013-09-02 08:16:45
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-04 16:34:57
首先用这两个酶做双酶切是不合适的，它们产生相同的粘性末端，跟单酶切没什么分别，理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试，NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题，祝好运！
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3楼2013-09-01 21:22:30
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ykluuniu

金虫 (小有名气)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:18
gyesang: 回帖置顶 2013-09-04 21:52:20
引用回帖:
3楼: Originally posted by cr507 at 2013-09-01 21:22:30
首先用这两个酶做双酶切是不合适的，它们产生相同的粘性末端，跟单酶切没什么分别，理论上会导致大量的载体自连。另外建议楼主缩短酶切时间试试，NEB的酶按说明书的体系切2小时就足够了。其他应该没什么问题，祝好运 ...

不同的酶，切出来的是不同的粘性末端，为什么和单酶切没有区别呢？你说的显然是不对的。
载体自连可能是因为双酶切过程中，有一个酶酶切不彻底的缘故。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2013-09-01 22:46:12
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