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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于引物设计
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machao8405

木虫 (正式写手)

[求助] 关于引物设计

一般设计引物时候都是从要扩增部分的两头设计引物往中间扩，但是我有一段序列，只有300bp左右，而且不知道两边的序列，针对这一序列，我还想扩到全长，我如何设计引物进行扩增
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1楼2013-08-02 14:57:38
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丹丹317

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-05 13:33:48
你可以先把你这段序列的5＇UTR和3＇UTR到相应的库里扩出来，然后再在这两端设计引物，可以试一下
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fighting
5楼2013-08-05 10:10:02
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-02 21:57:12
如果是cDNA要先做RACE，获取全长序列后，再设计引物

如果是基因组序列就做genome walking，然后再根据获得的序列设计引物扩增
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-08-02 16:39:42
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wangweida2

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-08-02 21:57:21
是扩增cDNA吗？RACE技术应该对你有所帮助。可以对5端未知序列和3端未知序列进行扩增。具体操作你可以查下资料，是比较成熟的技术。
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3楼2013-08-02 16:40:14
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piaofu

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
通过RACE很轻松的
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4楼2013-08-03 08:35:22
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