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梯度PCR退火温度
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duke188
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梯度PCR退火温度
上游TTACAAGATGGAGCCTCACC(GC含量50%)
Tm(1M Na+):68.2
Tm(50mM Na+):46.6
下游CAAAGAATAACCCAGGACGA(GC含量45%)
Tm(1M Na+):66.2
Tm(50mM Na+):44.6
顺便问下大家,Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+)有什么区别啊?
我该选择哪个Tm啊?
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1楼
2013-07-21 21:38:26
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duke188
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6楼
:
Originally posted by
xz2001199802
at 2013-07-22 18:31:43
eurofins给出你的引物Tm分别为57.3和55.3,所以我建议你用52 - 55°。我通常都是这么整的,应该没问题的
谢谢!DNA合成说明书上给的那些Tm没有用么
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8楼
2013-07-22 22:41:20
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shangrila911
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感谢参与,应助指数 +1
duke188(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助!
2013-07-21 23:05:54
Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+) 括号里面的表示盐浓度,盐浓度越高,Tm越高,不过还是根据自己的实际PCR情况而定,一般PCR常用Tm(50mM Na+)作参考...
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一切都会好的!
2楼
2013-07-21 22:01:11
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duke188
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2楼
:
Originally posted by
shangrila911
at 2013-07-21 22:01:11
Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+) 括号里面的表示盐浓度,盐浓度越高,Tm越高,不过还是根据自己的实际PCR情况而定,一般PCR常用Tm(50mM Na+)作参考...
我是新手,由于要做梯度PCR摸退火温度,按照Tm(50mM Na+)--5℃的话,退火温度是不是太低了
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3楼
2013-07-21 22:20:52
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cicelyzh
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感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2013-07-22 11:49:07
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3楼
:
Originally posted by
duke188
at 2013-07-21 22:20:52
我是新手,由于要做梯度PCR摸退火温度,按照Tm(50mM Na+)--5℃的话,退火温度是不是太低了...
一般PCR时的退火温度很少选在50°C以下。从你的引物大概是20nt,GC含量在50%左右,退火温度一般在55-60°C。你可以根据这个设计你的温度梯度。
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4楼
2013-07-22 04:27:58
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