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yangmindk

银虫 (初入文坛)

[求助] 通过梯度PCR摸索的最佳退火温度,扩出来的条带不太亮,帮忙分析那些引物不可以用

我是做SSR的,通过对30对引物进行梯度PCR,确定最佳退火温度,但是扩出来的条带依然不清晰,有的还是多条,不知道是非特异性扩增还是不同重复数的片段。用的是4%的琼脂糖凝胶,Marker是20bp,很郁闷啊,还请大家多多指教。

未命名.jpg



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yangmindk

银虫 (初入文坛)

怎么没回应呢?郁闷啊
明天会更好
2楼2012-11-24 18:40:33
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saintoy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你换聚丙烯胶跑跑看,这个也太模糊了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

saintoy@163.com
3楼2012-12-03 10:38:08
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yangmindk

银虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by saintoy at 2012-12-03 10:38:08
你换聚丙烯胶跑跑看,这个也太模糊了

嗯,这是PAGE胶跑的图片,12%的胶。帮忙看一下,谢谢哈.这是绵羊的

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明天会更好
4楼2012-12-03 12:21:20
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amilie030312

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

梯度PCR只是在不知道具体退货温度的时候拿来找个大概的温度范围,在确定大概的温度范围之后需要再精确的做单独温度,最终找到一个温度最高(特异性好),产量最高(最适温度)的温度点再来跑PCR,否则你这个没有办法得到很准确的结果,垂直板不就跑成那个样子了嘛。
5楼2012-12-03 16:45:54
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hyc_charles

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这个是变性胶嘛?你这个PAGE胶跑的挺好的啊,垂直板跑出来这种的算是比较清楚的了。最下端的那部分不清楚,可以不用管它了。你是做什么,多态性分析么?
不但要做一个优秀的人,更要做一个无可取代的人…
6楼2013-07-22 18:55:03
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