24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3569  |  回复: 12

summermio

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于双酶切后回收的问题

各位大神
我最近在做原核表达。我的蛋白编码基因大小大约只有300bp,用带酶切位点的引物p出来后连19T载体测序正确。然后用Bam HI和Hind III这两种酶切3小时。但是酶切完每次跑电泳下来切下来的T载体的条带特别亮,但是目的片段特别暗,几条带一起回收都回收不出来东西。实在很郁闷。是不是因为我的目的片段相对于T载体太小了?有什么办法能解决么?

或者我能不能直接从含T载体的大肠杆菌菌液里pcr出目的片段直接双酶切?
希望各位赐教哈
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

stevenshi021

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
summermio(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,感谢你的慷慨解囊,期待你的精彩。 2013-05-26 13:29:00
你当然可以直接PCR扩增,虽然那个可能会有引入突变的风险(当然比较小)。至于亮度的问题是因为其条带小,亮度是与DNA量成正比的。你的载体与小片段如果酶切完全,其亮度比例应该是与其DNA长度比例一致。
2楼2013-05-26 06:13:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dcb005

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
size 越小,结合的EB就越少,越弱,正常的
★穷则独善其身,达则兼济天下★
8楼2013-05-27 17:37:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dcb005

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

可以引物加酶切位点,再加保护碱基,直接切PCR产物
★穷则独善其身,达则兼济天下★
9楼2013-05-27 17:39:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjtu0025

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
summermio(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-29 19:12:37
我跟你一样,我跑的两个片段切下一个310,一个259.连的是18T。一开始怎么都看不到,然后大量切才一点点,然后回收率低的想哭。浪费时间啊。。你看,3ug就要切60ul上样的时候就要大孔,这样就要切多的胶。损失率高啊。

后来我思考了一个办法,发现很好用。我是用PCR机酶切的,切完以后开PCR机盖子,开pcr管盖子,设定到70度,蒸它1个小时。然后体积就从60变成30了。然后你做3管这样的,可以更狠一点,直接蒸到15ul一管。然后45ul用一个大孔跑。包你切到漂漂亮亮的。。

不过其实我用之前那种很多一起跑,最后胶回收的时候全部浓缩到一个管里面,30ul。出来的浓度有2ng/ul。也能跟5900bp的表达载体连接。
10楼2013-05-27 23:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

summermio

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
11楼: Originally posted by m_marion at 2013-05-28 00:01:45
才300bp,当然直接用高保真酶PCR后酶切,反正你后面拼好还是要测序的。

我用Takara PrimerSTAR对4~6Kbp的整个质粒作PCR作过多次,从没出过突变,你要是担心实验进度,顶多是PCR酶切连接后挑两个长度检测正确的样 ...

多谢。我在实验室的情况比较特殊,不能直接向领导要求买酶的。= =
只好用taq酶p了片段酶切转化后取菌液pcr了一下看上去也初步正确。送了5管测序,但愿有对的吧。
12楼2013-05-31 13:02:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

j134104

金虫 (小有名气)

完全赞成2楼。一般我们就是这样做的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-05-26 08:32:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2013-05-27 10:34:25
300bp的PCR出错的概率不大。但我认为完全没有必要再做PCR。酶切后电泳条带不亮是因为片段小。你可以适当增加酶切时的质粒用量就可以了。你可以估算一下,切5μg质粒,才能有大致0.5μg的目的片段出来。再加上切胶回收会有一些损失,最后的产率可想而知了。虽然连接需要的DNA量很少,但为了保证回收片段的浓度,我认为你至少需要切5-10μg的质粒。
4楼2013-05-26 15:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Renavatio

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是用EB加在加在胶里面跑的?如果是的话   溴酚蓝那条带不要跑过二分之一,跑过的话 下面的EB都快跑没了
Undefined!
5楼2013-05-27 10:02:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chyanqiu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
summermio(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-29 19:11:48
如果你坚持用酶切的方法,我建议用高浓度的胶。在高浓度胶中,300bp的迁移率不是很快,我用这种方法回收150bp片段的
6楼2013-05-27 14:49:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-29 19:11:59
楼主不要担心条带亮否的问题, 这个亮度是和DNA长度有关系的。 同样数量的DNA分子, 长度越大在胶里的亮度越亮。T4连接的时候关键的是分子数量而不是ng/ul,  楼主只要在乎你切质粒的时候起始浓度是不是在一般范围里面, 如果是的话你回收的片段就是够数量的。
7楼2013-05-27 15:16:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 summermio 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 315求调剂 +3 &123456789 2026-04-05 3/150 2026-04-05 11:57 by rainbow11
[有机交流] 甲醇/二氯 1:15过柱子 5+3 a哎y呦w喂 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:42 by 88817753
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 301求调剂 +12 121. 2026-04-04 12/600 2026-04-05 09:00 by 来看流星雨10
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +16 披星河 2026-04-03 16/800 2026-04-05 09:00 by dick_runner
[考研] 313求调剂 +3 海日海日 2026-04-04 3/150 2026-04-05 07:57 by 544594351
[考研] 一志愿郑大0705求调剂 +3 橘十一 2026-04-02 4/200 2026-04-05 00:05 by chongya
[考研] 考研调剂 +6 15615482637 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:43 by yu221
[考研] 085600调剂 +8 东照照照 2026-04-04 8/400 2026-04-04 22:26 by oooqiao
[考研] 求调剂,一志愿北京中医药大学 +3 小小达不溜 2026-04-02 3/150 2026-04-03 22:55 by 冲矢昴星团
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +39 洛神哥哥 2026-03-31 41/2050 2026-04-03 21:51 by qlm5820
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:19 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿上海海洋大学083200食品学硕,求调剂,接受其他专业 +6 what张 2026-04-01 7/350 2026-04-02 16:48 by zzsw+
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +8 cs0106 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:36 by 不吃魚的貓
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 353求调剂 +4 拉钩不许变 2026-04-01 4/200 2026-04-01 18:10 by 记事本2026
[考研] 0703一志愿南师大334求调剂 +4 seven7yu 2026-03-30 4/200 2026-04-01 16:10 by oooqiao
[考研] 一志愿北交材料工程总分358 +5 cs0106 2026-04-01 7/350 2026-04-01 11:45 by wangjy2002
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
信息提示
请填处理意见