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xuzhe2240

银虫 (初入文坛)

[求助] 大引物PCR所出现的问题,求助 已有1人参与

本人最近在做易错PCR,参考文献使用MEGAWHOP Cloning的方法,使用易错PCR产物(大约1200bp左右)作为引物,全质粒作为模版进行PCR。体系中使用了Takara的PrimeSTAR HS DNA Polymerase,总体积100微升,20微升5*PS Buffer,8微升dNTPs,4微升易错PCR回收片段,1微升全质粒模版,1微升酶,分装之后进行PCR。PCR条件为72℃-5min,98℃-3min,98℃-10s,60-65℃-10s,72℃-6min(30个循环),72℃-10min,4℃-保存。
现在出现以下问题:1.PCR后0.9%琼脂糖凝胶电泳检测,胶孔非常亮,但是应该不会有蛋白质和基因组污染的问题。2.PCR产生的条带偏大很多,图中所用的是DL10000的Marker,有一条明显的10000+条带。3.PCR产物经过DpnI消化后转化涂平板,没办法长,尝试过对PCR产物进行浓缩,但是效果不佳。
希望大家帮我分析一下问题出在哪儿,先谢谢大家了。

xz20130401.jpg
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15222569263

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tete1987 at 2013-12-20 16:25:04
我现在也在做全质粒PCR构建文库,用的跟你相同的条件。今天刚做完第二步PCR,点了8ul,能够看见条带。
我觉得这种方法应该P不出来很亮的质粒条带;
质粒很大,电泳看大小不准确;
所以楼主可以多点写样品看一 ...

问一下做的结果如何?我现在也在做易错PCR,但是转化均为假阳性。。。
3楼2016-03-17 21:34:57
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tete1987

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我现在也在做全质粒PCR构建文库,用的跟你相同的条件。今天刚做完第二步PCR,点了8ul,能够看见条带。
我觉得这种方法应该P不出来很亮的质粒条带;
质粒很大,电泳看大小不准确;
所以楼主可以多点写样品看一下,能看到一点条带就可以做转化;
具体结果要以转化出来为准。
今天晚上做转化,转化出来结果再告诉你。
嘿嘿,just for you~
2楼2013-12-20 16:25:04
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