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风惊雨

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 关于BIOSUM62打分矩阵的一个问题

BIOSUM62打分矩阵为什么是对称的啊,这个想不通,还有对角线上的数字是干嘛的……
求助求指点啊

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优秀是一种习惯
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先是BLOSUM 而不是BIOSUM
细节可以去http://en.wikipedia.org/wiki/BLOSUM阅读下。
对角线上的数值是没有mutation的情况,必须有,在做sequence alignment的时候起到加分的作用
2楼2012-12-16 08:55:40
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风惊雨

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-12-16 08:55:40
首先是BLOSUM 而不是BIOSUM
细节可以去http://en.wikipedia.org/wiki/BLOSUM阅读下。
对角线上的数值是没有mutation的情况,必须有,在做sequence alignment的时候起到加分的作用

感谢,感觉挺有用的(那个是笔误……)
优秀是一种习惯
3楼2012-12-16 09:48:34
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